RAB5C

RAB5C
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4KYI
Ідентифікатори
Символи	RAB5C, L1880, RAB5CL, RAB5L, RABL, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 604037 MGI: 105306 HomoloGene: 55533 GeneCards: RAB5C
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GTP binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GDP binding; • GO:0006184 GTPase activity;
Клітинна компонента	• Меланосома; • lysosomal membrane; • ендосома; • lipid droplet; • endocytic vesicle; • early endosome; • екзосома; • мембрана; • клітинна мембрана; • early endosome membrane; • azurophil granule membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • anchored component of synaptic vesicle membrane; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• protein transport; • regulation of endocytosis; • plasma membrane to endosome transport; • neutrophil degranulation; • GO:0015915 транспорт; • intracellular protein transport; • Rab protein signal transduction; • small GTPase mediated signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5878
	19345
	ENSG00000108774
	ENSMUSG00000019173
	P51148
	P35278
	NM_001252039; NM_004583; NM_201434
	NM_024456; NM_001305003
	NP_001238968; NP_004574; NP_958842
	NP_001291932; NP_077776
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAB5C (англ. RAB5C, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 216 амінокислот, а молекулярна маса — 23 483^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGRGGAARP	NGPAAGNKIC	QFKLVLLGES	AVGKSSLVLR	FVKGQFHEYQ
ESTIGAAFLT	QTVCLDDTTV	KFEIWDTAGQ	ERYHSLAPMY	YRGAQAAIVV
YDITNTDTFA	RAKNWVKELQ	RQASPNIVIA	LAGNKADLAS	KRAVEFQEAQ
AYADDNSLLF	METSAKTAMN	VNEIFMAIAK	KLPKNEPQNA	TGAPGRNRGV
DLQENNPASR	SQCCSN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

Clemens D.L., Lee B.-Y., Horwitz M.A. (2000). Deviant expression of Rab5 on phagosomes containing the intracellular pathogens Mycobacterium tuberculosis and Legionella pneumophila is associated with altered phagosomal fate. Infect. Immun. 68: 2671—2684. PMID 10768959 DOI:10.1128/IAI.68.5.2671-2684.2000
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Merithew E., Stone C., Eathiraj S., Lambright D.G. (2003). Determinants of Rab5 interaction with the N-terminus of early endosome antigen 1. J. Biol. Chem. 278: 8494—8500. PMID 12493736 DOI:10.1074/jbc.M211514200
Han H.J., Sudo K., Inazawa J., Nakamura Y. (1996). Isolation and mapping of a human gene (RABL) encoding a small GTP-binding protein homologous to the Ras-related RAB gene. Cytogenet. Cell Genet. 73: 137—139. PMID 8646882