RAB21

RAB21 (англ. RAB21, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 225 амінокислот, а молекулярна маса — 24 348.

RAB21
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1YZT, 1YZU, 1Z08, 1Z0I, 2OT3
Ідентифікатори
Символи	RAB21, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 612398 MGI: 894308 HomoloGene: 8991 GeneCards: RAB21
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GDP binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • ендосома • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • focal adhesion • vesicle membrane • Golgi membrane • Golgi cisterna membrane • trans-Golgi network • ендоплазматичний ретикулум • neuron projection • cytoplasmic side of plasma membrane • cytoplasmic side of early endosome membrane • Борозна розщеплення • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • axon cytoplasm • гіалоплазма • early endosome membrane • early endosome • синапс Біологічний процес • positive regulation of receptor-mediated endocytosis • regulation of axon extension • anterograde axonal transport • regulation of exocytosis • positive regulation of dendrite morphogenesis • protein transport • positive regulation of early endosome to late endosome transport • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23011	216344
Ensembl	ENSG00000080371	ENSMUSG00000020132
UniProt	Q9UL25	P35282
RefSeq (мРНК)	NM_014999	NM_024454
RefSeq (білок)	NP_055814	NP_077774
Локус (UCSC)	Хр. 12: 71.75 – 71.8 Mb	Хр. 10: 115.12 – 115.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAGGGGGG		AAAAGRAYSF		KVVLLGEGCV		GKTSLVLRYC		ENKFNDKHIT
TLQASFLTKK		LNIGGKRVNL		AIWDTAGQER		FHALGPIYYR		DSNGAILVYD
ITDEDSFQKV		KNWVKELRKM		LGNEICLCIV		GNKIDLEKER		HVSIQEAESY
AESVGAKHYH		TSAKQNKGIE		ELFLDLCKRM		IETAQVDERA		KGNGSSQPGT
ARRGVQIIDD		EPQAQTSGGG		CCSSG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang X., He X., Fu X.-Y., Chang Z. (2006). Varp is a Rab21 guanine nucleotide exchange factor and regulates endosome dynamics. J. Cell Sci. 119: 1053—1062. PMID 16525121 DOI:10.1242/jcs.02810
• Eathiraj S., Pan X., Ritacco C., Lambright D.G. (2005). Structural basis of family-wide Rab GTPase recognition by rabenosyn-5. Nature. 436: 415—419. PMID 16034420 DOI:10.1038/nature03798
• Delprato A., Lambright D.G. (2007). Structural basis for Rab GTPase activation by VPS9 domain exchange factors. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 406—412. PMID 17450153 DOI:10.1038/nsmb1232

Див. також

• Хромосома 12