RAB12

RAB12 (англ. RAB12, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 244 амінокислот, а молекулярна маса — 27 248.

RAB12
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IL1
Ідентифікатори
Символи	RAB12, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 616448 MGI: 894284 HomoloGene: 103879 GeneCards: RAB12
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GDP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • autophagosome • lysosomal membrane • Golgi membrane • лізосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • мембрана • гіалоплазма • recycling endosome membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • phagocytic vesicle • endoplasmic reticulum membrane • trans-Golgi network Біологічний процес • автофагія • protein transport • positive regulation of macroautophagy • endosome to lysosome transport • cellular response to interferon-gamma • intracellular protein transport • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • Rab protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	201475	19328
Ensembl	ENSG00000206418	ENSMUSG00000023460
UniProt	Q6IQ22	P35283
RefSeq (мРНК)	NM_001025300	NM_024448
RefSeq (білок)	NP_001020471	NP_077768
Локус (UCSC)	Хр. 18: 8.61 – 8.64 Mb	Хр. 17: 66.8 – 66.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPGAALQRR		AGGGGGLGAG		SPALSGGQGR		RRKQPPRPAD		FKLQVIIIGS
RGVGKTSLME		RFTDDTFCEA		CKSTVGVDFK		IKTVELRGKK		IRLQIWDTAG
QERFNSITSA		YYRSAKGIIL		VYDITKKETF		DDLPKWMKMI		DKYASEDAEL
LLVGNKLDCE		TDREITRQQG		EKFAQQITGM		RFCEASAKDN		FNVDEIFLKL
VDDILKKMPL		DILRNELSNS		ILSLQPEPEI		PPELPPPRPH		VRCC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до фосфопротеїнів, ліпопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, автофагія, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yoshimura S., Gerondopoulos A., Linford A., Rigden D.J., Barr F.A. (2010). Family-wide characterization of the DENN domain Rab GDP-GTP exchange factors. J. Cell Biol. 191: 367—381. PMID 20937701 DOI:10.1083/jcb.201008051

Див. також

• Хромосома 18