QTRT1

QTRT1 (англ. Queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 403 амінокислот, а молекулярна маса — 44 048.

QTRT1
Ідентифікатори
Символи	QTRT1, FP3235, TGT, TGUT, queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609615 MGI: 1931441 HomoloGene: 11061 GeneCards: QTRT1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • glycosyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • protein heterodimerization activity • protein homodimerization activity • pentosyltransferase activity • queuine tRNA-ribosyltransferase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • мітохондрія • цитоплазма • мітохондріальна зовнішня мембрана • мембрана • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • tRNA modification • tRNA processing • tRNA-guanine transglycosylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81890	60507
Ensembl	ENSG00000213339	ENSMUSG00000002825
UniProt	Q9BXR0	Q9JMA2
RefSeq (мРНК)	NM_031209	NM_021888
RefSeq (білок)	NP_112486	NP_068688
Локус (UCSC)	Хр. 19: 10.7 – 10.71 Mb	Хр. 9: 21.32 – 21.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGAATQASL		ESAPRIMRLV		AECSRSRARA		GELWLPHGTV		ATPVFMPVGT
QATMKGITTE		QLDALGCRIC		LGNTYHLGLR		PGPELIQKAN		GLHGFMNWPH
NLLTDSGGFQ		MVSLVSLSEV		TEEGVRFRSP		YDGNETLLSP		EKSVQIQNAL
GSDIIMQLDD		VVSSTVTGPR		VEEAMYRSIR		WLDRCIAAHQ		RPDKQNLFAI
IQGGLDADLR		ATCLEEMTKR		DVPGFAIGGL		SGGESKSQFW		RMVALSTSRL
PKDKPRYLMG		VGYATDLVVC		VALGCDMFDC		VFPTRTARFG		SALVPTGNLQ
LRKKVFEKDF		GPIDPECTCP		TCQKHSRAFL		HALLHSDNTA		ALHHLTVHNI
AYQLQLMSAV		RTSIVEKRFP		DFVRDFMGAM		YGDPTLCPTW		ATDALASVGI
TLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг тРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

• Deshpande K.L., Katze J.R. (2001). Characterization of cDNA encoding the human tRNA-guanine transglycosylase (TGT) catalytic subunit. Gene. 265: 205—212. PMID 11255023 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00368-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chen Y.C., Kelly V.P., Stachura S.V., Garcia G.A. (2010). Characterization of the human tRNA-guanine transglycosylase: confirmation of the heterodimeric subunit structure. RNA. 16: 958—968. PMID 20354154 DOI:10.1261/rna.1997610

Див. також

• Хромосома 19