QKI

QKI (англ. QKI, KH domain containing RNA binding) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот, а молекулярна маса — 37 671.

QKI
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4JVH
Ідентифікатори
Символи	QKI, Hqk, QK, QK1, QK3, hqkI, KH domain containing, RNA binding, KH domain containing RNA binding
Зовнішні ІД	OMIM: 609590 MGI: 97837 HomoloGene: 11059 GeneCards: QKI
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • mRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • синапс Біологічний процес • диференціація клітин • mRNA transport • mRNA processing • васкулогенез • multicellular organism development • axon ensheathment • muscle cell differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • long-chain fatty acid biosynthetic process • Сплайсинг РНК • spermatid development • myelination • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization • regulation of translation • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9444	19317
Ensembl	ENSG00000112531	ENSMUSG00000062078
UniProt	Q96PU8	Q9QYS9
RefSeq (мРНК)	NM_001301085 NM_006775 NM_206853 NM_206854 NM_206855	NM_001159516 NM_001159517 NM_021881
RefSeq (білок)	NP_001288014 NP_006766 NP_996735 NP_996736 NP_996737	NP_001152988 NP_001152989 NP_068681
Локус (UCSC)	Хр. 6: 163.41 – 163.58 Mb	Хр. 17: 10.42 – 10.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVGEMETKEK		PKPTPDYLMQ		LMNDKKLMSS		LPNFCGIFNH		LERLLDEEIS
RVRKDMYNDT		LNGSTEKRSA		ELPDAVGPIV		QLQEKLYVPV		KEYPDFNFVG
RILGPRGLTA		KQLEAETGCK		IMVRGKGSMR		DKKKEEQNRG		KPNWEHLNED
LHVLITVEDA		QNRAEIKLKR		AVEEVKKLLV		PAAEGEDSLK		KMQLMELAIL
NGTYRDANIK		SPALAFSLAA		TAQAAPRIIT		GPAPVLPPAA		LRTPTPAGPT
IMPLIRQIQT		AVMPNGTPHP		TAAIVPPGPE		AGLIYTPYEY		PYTLAPATSI
LEYPIEPSGV		LGAVATKVRR		HDMRVHPYQR		IVTADRAATG		N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cote J., Boisvert F.-M., Boulanger M.-C., Bedford M.T., Richard S. (2003). Sam68 RNA binding protein is an in vivo substrate for protein arginine N-methyltransferase 1. Mol. Biol. Cell. 14: 274—287. PMID 12529443 DOI:10.1091/mbc.E02-08-0484
• Aberg K., Saetre P., Jareborg N., Jazin E. (2006). Human QKI, a potential regulator of mRNA expression of human oligodendrocyte-related genes involved in schizophrenia. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 7482—7487. PMID 16641098 DOI:10.1073/pnas.0601213103

Див. також

• Хромосома 6