PYGO2

PYGO2 (англ. Pygopus family PHD finger 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 41 244.

PYGO2
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XB1, 4UP0, 4UP5
Ідентифікатори
Символи	PYGO2, 1190004M21Rik, pygopus family PHD finger 2
Зовнішні ІД	OMIM: 606903 MGI: 1916161 HomoloGene: 44519 GeneCards: PYGO2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0031493 histone binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • histone acetyltransferase regulator activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • beta-catenin-TCF complex Біологічний процес • roof of mouth development • regulation of histone H3-K4 methylation • in utero embryonic development • regulation of mammary gland epithelial cell proliferation • positive regulation of chromatin binding • mammary gland development • brain development • lens development in camera-type eye • developmental growth • regulation of histone acetylation • spermatid development • canonical Wnt signaling pathway • beta-catenin-TCF complex assembly • розвиток нирки • spermatid nucleus differentiation • post-embryonic development • Wnt signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	90780	68911
Ensembl	ENSG00000163348	ENSMUSG00000047824
UniProt	Q9BRQ0	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_138300	NM_001293763 NM_001293766 NM_001293767 NM_001293768 NM_026869
RefSeq (білок)	NP_612157	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 154.96 – 154.96 Mb	Хр. 3: 89.34 – 89.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAASAPPPPD		KLEGGGGPAP		PPAPPSTGRK		QGKAGLQMKS		PEKKRRKSNT
QGPAYSHLTE		FAPPPTPMVD		HLVASNPFED		DFGAPKVGVA		APPFLGSPVP
FGGFRVQGGM		AGQVPPGYST		GGGGGPQPLR		RQPPPFPPNP		MGPAFNMPPQ
GPGYPPPGNM		NFPSQPFNQP		LGQNFSPPSG		QMMPGPVGGF		GPMISPTMGQ
PPRAELGPPS		LSQRFAQPGA		PFGPSPLQRP		GQGLPSLPPN		TSPFPGPDPG
FPGPGGEDGG		KPLNPPASTA		FPQEPHSGSP		AAAVNGNQPS		FPPNSSGRGG
GTPDANSLAP		PGKAGGGSGP		QPPPGLVYPC		GACRSEVNDD		QDAILCEASC
QKWFHRECTG		MTESAYGLLT		TEASAVWACD		LCLKTKEIQS		VYIREGMGQL
VAANDG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як сигнальний шлях Wnt, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1