PYGM

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

PYGM (англ. Glycogen phosphorylase, muscle associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 842 амінокислот, а молекулярна маса — 97 092[5].

PYGM
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PYGM, glycogen phosphorylase, muscle associated, GSD5
Зовнішні ІД OMIM: 608455 MGI: 97830 HomoloGene: 2145 GeneCards: PYGM
Пов'язані генетичні захворювання
glycogen storage disease V[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_005609
NM_001164716
NM_011224
RefSeq (білок)
NP_001158188
NP_005600
NP_035354
Локус (UCSC) н/д Хр. 19: 6.43 – 6.45 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSRPLSDQEKRKQISVRGLAGVENVTELKKNFNRHLHFTLVKDRNVATPR
DYYFALAHTVRDHLVGRWIRTQQHYYEKDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTM
VNLALENACDEATYQLGLDMEELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMAT
LGLAAYGYGIRYEFGIFNQKISGGWQMEEADDWLRYGNPWEKARPEFTLP
VHFYGHVEHTSQGAKWVDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNVVNTMRLWSAKAP
NDFNLKDFNVGGYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPEL
MRILVDLERMDWDKAWDVTVRTCAYTNHTVLPEALERWPVHLLETLLPRH
LQIIYEINQRFLNRVAAAFPGDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGS
HAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKFQNKTNGITPRRWLVLCNPGL
AEVIAERIGEDFISDLDQLRKLLSFVDDEAFIRDVAKVKQENKLKFAAYL
EREYKVHINPNSLFDIQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKREPNKFFV
PRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIRLVTAIGDVVNHDPAVGDRLRVIFLENYR
VSLAEKVIPAADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEM
AEEAGEENFFIFGMRVEDVDKLDQRGYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGF
FSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEDYIKCQEKVSALYKNPREWTR
MVIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPAPDEAI

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як вуглеводний обмін, метаболізм глікогену, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, піридоксаль-фосфатом.

Література ред.

  • Kubisch C., Wicklein E.M., Jentsch T.J. (1998). Molecular diagnosis of McArdle disease: revised genomic structure of the myophosphorylase gene and identification of a novel mutation. Hum. Mutat. 12: 27—32. PMID 9633816 DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(1998)12:1<27::AID-HUMU4>3.0.CO;2-#
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Tsujino S., Shanske S., Dimauro S. (1993). Molecular genetic heterogeneity of myophosphorylase deficiency (McArdle's disease). N. Engl. J. Med. 329: 241—245. PMID 8316268 DOI:10.1056/NEJM199307223290404
  • Tsujino S., Shanske S., Martinuzzi A., Heiman-Patterson T., Dimauro S. (1995). Two novel missense mutations (E654K, L396P) in Caucasian patients with myophosphorylase deficiency (McArdle's disease). Hum. Mutat. 6: 276—277. PMID 8535454 DOI:10.1002/humu.1380060318
  • Tsujino S., Shanske S., Nonaka I., DiMauro S. (1995). The molecular genetic basis of myophosphorylase deficiency (McArdle's disease). Muscle Nerve. 3: S23—S27. PMID 7603523 DOI:10.1002/mus.880181407
  • Rubio J.C., Martin M.A., Campos Y., Cabello A., Arenas J. (2000). A missense mutation T487N in the myophosphorylase gene in a Spanish patient with McArdle's disease. Neuromuscul. Disord. 10: 138—140. PMID 10714589 DOI:10.1016/S0960-8966(99)00082-6

Примітки ред.

Див. також ред.