PXDNL

PXDNL (англ. Peroxidasin like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 463 амінокислот, а молекулярна маса — 163 686.

PXDNL
Ідентифікатори
Символи	PXDNL, PMR1, PRM1, VPO2, peroxidasin like
Зовнішні ІД	OMIM: 615904 HomoloGene: 71125 GeneCards: PXDNL
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • endonuclease activity • oxidoreductase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • heme binding • peroxidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • GO:0001306 response to oxidative stress • hydrogen peroxide catabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • cellular oxidant detoxification Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	137902	191484
Ensembl	ENSG00000147485	WBGene00004256
UniProt	A1KZ92 K4DIA6	Q1ENI8
RefSeq (мРНК)	NM_144651	NM_072787
RefSeq (білок)	NP_653252	NP_505188
Локус (UCSC)	Хр. 8: 51.32 – 51.81 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPRLFCWTT		LFLLAGWCLP		GLPCPSRCLC		FKSTVRCMHL		MLDHIPQVPQ
QTTVLDLRFN		RIREIPGSAF		KKLKNLNTLL		LNNNHIRKIS		RNAFEGLENL
LYLYLYKNEI		HALDKQTFKG		LISLEHLYIH		FNQLEMLQPE		TFGDLLRLER
LFLHNNKLSK		IPAGSFSNLD		SLKRLRLDSN		ALVCDCDLMW		LGELLQGFAQ
HGHTQAAATC		EYPRRLHGRA		VASVTVEEFN		CQSPRITFEP		QDVEVPSGNT
VYFTCRAEGN		PKPEIIWIHN		NHSLDLEDDT		RLNVFDDGTL		MIRNTRESDQ
GVYQCMARNS		AGEAKTQSAM		LRYSSLPAKP		SFVIQPQDTE		VLIGTSTTLE
CMATGHPHPL		ITWTRDNGLE		LDGSRHVATS		SGLYLQNITQ		RDHGRFTCHA
NNSHGTVQAA		ANIIVQAPPQ		FTVTPKDQVV		LEEHAVEWLC		EADGNPPPVI
VWTKTGGQLP		VEGQHTVLSS		GTLRIDRAAQ		HDQGQYECQA		VSSLGVKKVS
VQLTVKPKAL		AVFTQLPQDT		SVEVGKNINI		SCHAQGEPQP		IITWNKEGVQ
ITESGKFHVD		DEGTLTIYDA		GFPDQGRYEC		VARNSFGLAV		TNMFLTVTAI
QGRQAGDDFV		ESSILDAVQR		VDSAINSTRR		HLFSQKPHTS		SDLLAQFHYP
RDPLIVEMAR		AGEIFEHTLQ		LIRERVKQGL		TVDLEGKEFR		YNDLVSPRSL
SLIANLSGCT		ARRPLPNCSN		RCFHAKYRAH		DGTCNNLQQP		TWGAALTAFA
RLLQPAYRDG		IRAPRGLGLP		VGSRQPLPPP		RLVATVWARA		AAVTPDHSYT
RMLMHWGWFL		EHDLDHTVPA		LSTARFSDGR		PCSSVCTNDP		PCFPMNTRHA
DPRGTHAPCM		LFARSSPACA		SGRPSATVDS		VYAREQINQQ		TAYIDGSNVY
GSSERESQAL		RDPSVPRGLL		KTGFPWPPSG		KPLLPFSTGP		PTECARQEQE
SPCFLAGDHR		ANEHLALAAM		HTLWFREHNR		MATELSALNP		HWEGNTVYQE
ARKIVGAELQ		HITYSHWLPK		VLGDPGTRML		RGYRGYNPNV		NAGIINSFAT
AAFRFGHTLI		NPILYRLNAT		LGEISEGHLP		FHKALFSPSR		IIKEGGIDPV
LRGLFGVAAK		WRAPSYLLSP		ELTQRLFSAA		YSAAVDSAAT		IIQRGRDHGI
PPYVDFRVFC		NLTSVKNFED		LQNEIKDSEI		RQKLRKLYGS		PGDIDLWPAL
MVEDLIPGTR		VGPTLMCLFV		TQFQRLRDGD		RFWYENPGVF		TPAQLTQLKQ
ASLSRVLCDN		GDSIQQVQAD		VFVKAEYPQD		YLNCSEIPKV		DLRVWQDCCA
DCRSRGQFRA		VTQESQKKRS		AQYSYPVDKD		MELSHLRSRQ		QDKIYVGEDA
RNVTVLAKTK		FSQDFSTFAA		EIQETITALR		EQINKLEARL		RQAGCTDVRG
VPRKAEERWM		KEDCTHCICE		SGQVTCVVEI		CPPAPCPSPE		LVKGTCCPVC
RDRGMPSDSP		EKR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, гідролаз, пероксидаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як перекис водню, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном заліза, гемом. Локалізований у цитоплазмі. Також секретований назовні.

Література

• Cheng G., Salerno J.C., Cao Z., Pagano P.J., Lambeth J.D. (2008). Identification and characterization of VPO1, a new animal heme-containing peroxidase. Free Radic. Biol. Med. 45: 1682—1694. PMID 18929642 DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2008.09.009
• Bremer K.A., Stevens A., Schoenberg D.R. (2003). An endonuclease activity similar to Xenopus PMR1 catalyzes the degradation of normal and nonsense-containing human beta-globin mRNA in erythroid cells. RNA. 9: 1157—1167. PMID 12923263 DOI:10.1261/rna.5720303

Див. також

• Хромосома 8