PXDN

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

PXDN (англ. Peroxidasin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 479 амінокислот, а молекулярна маса — 165 275[5].

PXDN
Ідентифікатори
Символи PXDN, COPOA, D2S448, D2S448E, MG50, PRG2, PXN, VPO, peroxidasin, ASGD7
Зовнішні ІД OMIM: 605158 MGI: 1916925 HomoloGene: 33907 GeneCards: PXDN
Пов'язані генетичні захворювання
anterior segment dysgenesis 7[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_012293
NM_181395
NM_177804
RefSeq (білок)
NP_036425
NP_852060
Локус (UCSC) Хр. 2: 1.63 – 1.74 Mb Хр. 12: 29.99 – 30.07 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAKRSRGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCM
HLLLEAVPAVAPQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKR
IPSGAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLD
PDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGTFNHLESMKRLRLDSNTLHCDCEI
LWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCERPRITS
EPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDG
TLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQN
TEVLVGESVTLECSATGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQ
NVVQGDSGEYACSATNNIDSVHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTV
DFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLSVDRRHLVLSSGTLRISGVALHDQGQY
ECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTVEVGANVQLPCSSQG
EPEPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTI
GSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSR
PRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNG
TSYHYNDLVSPQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNN
LQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVST
TLIGTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALSQARFSDGQHCSNV
CSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLLMNSVYPR
EQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQRSGKPLLP
FATGPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIAT
ELLKLNPHWDGDTIYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTLGEY
HGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTLVNPLLYRLDENFQPIAQDHLPLHK
AFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLNTELTERLFSMAHTV
ALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPEIREK
LKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLW
YENPGVFSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGS
CDEIPRVDLRVWQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKK
TRPRKIPSVGRQGEHLSNSTSAFSTRSDASGTNDFREFVLEMQKTITDLR
TQIKKLESRLSTTECVDAGGESHANNTKWKKDACTICECKDGQVTCFVEA
CPPATCAVPVNIPGACCPVCLQKRAEEKP

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, пероксидаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як перекис водню, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном заліза, гемом. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література ред.

  • Horikoshi N., Cong J., Kley N., Shenk T. (1999). Isolation of differentially expressed cDNAs from p53-dependent apoptotic cells: activation of the human homologue of the Drosophila peroxidasin gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 261: 864—869. PMID 10441517 DOI:10.1006/bbrc.1999.1123
  • Cheng G., Salerno J.C., Cao Z., Pagano P.J., Lambeth J.D. (2008). Identification and characterization of VPO1, a new animal heme-containing peroxidase. Free Radic. Biol. Med. 45: 1682—1694. PMID 18929642 DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2008.09.009
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Mitchell M.S., Kan-Mitchell J., Minev B., Edman C., Deans R.J. (2000). A novel melanoma gene (MG50) encoding the interleukin 1 receptor antagonist and six epitopes recognized by human cytolytic T lymphocytes. Cancer Res. 60: 6448—6456. PMID 11103812

Примітки ред.

Див. також ред.