PUDP

PUDP (англ. Pseudouridine 5'-phosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 25 249.

PUDP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3L5K
Ідентифікатори
Символи	PUDP, DXF68S1E, FAM16AX, GS1, HDHD1A, HDHD1, pseudouridine 5'-phosphatase
Зовнішні ІД	OMIM: 306480 MGI: 1914615 HomoloGene: 8093 GeneCards: PUDP
Онтологія гена Молекулярна функція • pseudouridine 5'-phosphatase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • молекулярна функція • magnesium ion binding Клітинна компонента • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • pyrimidine nucleoside salvage • обмін речовин • nucleotide metabolic process • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8226	67365
Ensembl	ENSG00000130021	ENSMUSG00000048875
UniProt	Q08623	Q9D5U5
RefSeq (мРНК)	NM_012080 NM_001135565 NM_001178135 NM_001178136	NM_026108
RefSeq (білок)	NP_001129037 NP_001171606 NP_001171607 NP_036212	NP_080384
Локус (UCSC)	Хр. X: 6.67 – 7.15 Mb	Хр. 18: 50.7 – 50.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPPQPVTH		LIFDMDGLLL		DTERLYSVVF		QEICNRYDKK		YSWDVKSLVM
GKKALEAAQI		IIDVLQLPMS		KEELVEESQT		KLKEVFPTAA		LMPGAEKLII
HLRKHGIPFA		LATSSGSASF		DMKTSRHKEF		FSLFSHIVLG		DDPEVQHGKP
DPDIFLACAK		RFSPPPAMEK		CLVFEDAPNG		VEAALAAGMQ		VVMVPDGNLS
RDLTTKATLV		LNSLQDFQPE		LFGLPSYE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм нуклеотидів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yen P.H., Ellison J., Salido E.C., Mohandas T., Shapiro L. (1992). Isolation of a new gene from the distal short arm of the human X chromosome that escapes X-inactivation. Hum. Mol. Genet. 1: 47—52. PMID 1284467 DOI:10.1093/hmg/1.1.47
• Preumont A., Rzem R., Vertommen D., Van Schaftingen E. (2010). HDHD1, which is often deleted in X-linked ichthyosis, encodes a pseudouridine-5'-phosphatase. Biochem. J. 431: 237—244. PMID 20722631 DOI:10.1042/BJ20100174

Див. також

• Хромосома X