PTPRN2

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

PTPRN2 (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type N2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 015 амінокислот, а молекулярна маса — 111 271[5].

PTPRN2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PTPRN2, IA-2beta, IAR, ICAAR, PTPRP, R-PTP-N2, protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, protein tyrosine phosphatase receptor type N2
Зовнішні ІД OMIM: 601698 MGI: 107418 HomoloGene: 2134 GeneCards: PTPRN2
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, короткозорість, шизофренія, біполярний афективний розлад[1]
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001308267
NM_001308268
NM_002847
NM_130842
NM_130843
NM_011215
RefSeq (білок)
NP_001295196
NP_001295197
NP_002838
NP_570857
NP_570858
NP_035345
Локус (UCSC) Хр. 7: 157.54 – 158.59 Mb Хр. 12: 116.45 – 117.24 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MGPPLPLLLLLLLLLPPRVLPAAPSSVPRGRQLPGRLGCLLEEGLCGASE
ACVNDGVFGRCQKVPAMDFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDY
TQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPARPSKHSVGSERRYSREGGAALANA
LRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDRFSESILTYVAHTS
ALTYPPGSRTQLREDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALSAYA
AQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSS
TGDGARIHTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARG
SPGRAALGESGEQADGPKATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLG
GLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEEETAGVENVKSQ
TYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQ
LEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADVEVL
GPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKL
KFLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEK
LSGLGGDPGADATAAYQELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDG
PIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWE
ALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDY
INASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAE
NGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNET
RTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAG
RSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALT
AVAEEVNAILKALPQ

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література ред.

  • Kawasaki E., Hutton J.C., Eisenbarth G.S. (1996). Molecular cloning and characterization of the human transmembrane protein tyrosine phosphatase homologue, phogrin, an autoantigen of type 1 diabetes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 227: 440—447. PMID 8878534 DOI:10.1006/bbrc.1996.1526
  • Cui L., Yu W.-P., de Aizpurua H.J., Schmidli R.S., Pallen C.J. (1996). Cloning and characterization of islet cell antigen-related protein-tyrosine phosphatase (PTP), a novel receptor-like PTP and autoantigen in insulin-dependent diabetes. J. Biol. Chem. 271: 24817—24823. PMID 8798755 DOI:10.1074/jbc.271.40.24817
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Sengelaub C.A., Navrazhina K., Ross J.B., Halberg N., Tavazoie S.F. (2016). PTPRN2 and PLCbeta1 promote metastatic breast cancer cell migration through PI(4,5)P2-dependent actin remodeling. EMBO J. 35: 62—76. PMID 26620550 DOI:10.15252/embj.201591973

Примітки ред.

Див. також ред.