PTPRK

PTPRK
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2C7S
Ідентифікатори
Символи	PTPRK, R-PTP-kappa, protein tyrosine phosphatase, receptor type K, protein tyrosine phosphatase receptor type K
Зовнішні ІД	OMIM: 602545 MGI: 103310 HomoloGene: 55693 GeneCards: PTPRK
Онтологія гена
Молекулярна функція	• beta-catenin binding; • phosphoprotein phosphatase activity; • gamma-catenin binding; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein tyrosine phosphatase activity; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; • protein kinase binding; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • cell-cell junction; • Адгезивні контакти; • photoreceptor outer segment; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • аксон; • neuronal cell body; • дендрит (нейробіологія); • leading edge membrane; • клітинна мембрана; • міжклітинні контакти; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• negative regulation of keratinocyte proliferation; • cellular response to UV; • GO:0016576 protein dephosphorylation; • negative regulation of cell cycle; • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species; • focal adhesion assembly; • адгезія клітин; • negative regulation of cell migration; • protein localization to cell surface; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • neuron projection development; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • cell migration; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • negative regulation of cell population proliferation; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5796
	19272
	ENSG00000152894; ENSG00000273993
	ENSMUSG00000019889
	Q15262
	P35822
NM_001135648; NM_001291981; NM_001291982; NM_001291983; NM_001291984;
	NM_002844
	NM_008983; NM_001359355; NM_001359356
NP_001129120; NP_001278910; NP_001278911; NP_001278912; NP_001278913;
	NP_002835
	NP_033009; NP_001346284; NP_001346285
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPRK (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type K) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 439 амінокислот, а молекулярна маса — 162 102^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDTTAAAALP	AFVALLLLSP	WPLLGSAQGQ	FSAGGCTFDD	GPGACDYHQD
LYDDFEWVHV	SAQEPHYLPP	EMPQGSYMIV	DSSDHDPGEK	ARLQLPTMKE
NDTHCIDFSY	LLYSQKGLNP	GTLNILVRVN	KGPLANPIWN	VTGFTGRDWL
RAELAVSTFW	PNEYQVIFEA	EVSGGRSGYI	AIDDIQVLSY	PCDKSPHFLR
LGDVEVNAGQ	NATFQCIATG	RDAVHNKLWL	QRRNGEDIPV	AQTKNINHRR
FAASFRLQEV	TKTDQDLYRC	VTQSERGSGV	SNFAQLIVRE	PPRPIAPPQL
LGVGPTYLLI	QLNANSIIGD	GPIILKEVEY	RMTSGSWTET	HAVNAPTYKL
WHLDPDTEYE	IRVLLTRPGE	GGTGLPGPPL	ITRTKCAEPM	RTPKTLKIAE
IQARRIAVDW	ESLGYNITRC	HTFNVTICYH	YFRGHNESKA	DCLDMDPKAP
QHVVNHLPPY	TNVSLKMILT	NPEGRKESEE	TIIQTDEDVP	GPVPVKSLQG
TSFENKIFLN	WKEPLDPNGI	ITQYEISYSS	IRSFDPAVPV	AGPPQTVSNL
WNSTHHVFMH	LHPGTTYQFF	IRASTVKGFG	PATAINVTTN	ISAPTLPDYE
GVDASLNETA	TTITVLLRPA	QAKGAPISAY	QIVVEELHPH	RTKREAGAME
CYQVPVTYQN	AMSGGAPYYF	AAELPPGNLP	EPAPFTVGDN	RTYQGFWNPP
LAPRKGYNIY	FQAMSSVEKE	TKTQCVRIAT	KAATEEPEVI	PDPAKQTDRV
VKIAGISAGI	LVFILLLLVV	ILIVKKSKLA	KKRKDAMGNT	RQEMTHMVNA
MDRSYADQST	LHAEDPLSIT	FMDQHNFSPR	YENHSATAES	SRLLDVPRYL
CEGTESPYQT	GQLHPAIRVA	DLLQHINLMK	TSDSYGFKEE	YESFFEGQSA
SWDVAKKDQN	RAKNRYGNII	AYDHSRVILQ	PVEDDPSSDY	INANYIDGYQ
RPSHYIATQG	PVHETVYDFW	RMIWQEQSAC	IVMVTNLVEV	GRVKCYKYWP
DDTEVYGDFK	VTCVEMEPLA	EYVVRTFTLE	RRGYNEIREV	KQFHFTGWPD
HGVPYHATGL	LSFIRRVKLS	NPPSAGPIVV	HCSAGAGRTG	CYIVIDIMLD
MAEREGVVDI	YNCVKALRSR	RINMVQTEEQ	YIFIHDAILE	ACLCGETAIP
VCEFKAAYFD	MIRIDSQTNS	SHLKDEFQTL	NSVTPRLQAE	DCSIACLPRN
HDKNRFMDML	PPDRCLPFLI	TIDGESSNYI	NAALMDSYRQ	PAAFIVTQYP
LPNTVKDFWR	LVYDYGCTSI	VMLNEVDLSQ	GCPQYWPEEG	MLRYGPIQVE
CMSCSMDCDV	INRIFRICNL	TRPQEGYLMV	QQFQYLGWAS	HREVPGSKRS
FLKLILQVEK	WQEECEEGEG	RTIIHCLNGG	GRSGMFCAIG	IVVEMVKRQN
VVDVFHAVKT	LRNSKPNMVE	APEQYRFCYD	VALEYLESS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

Fuchs M., Mueller T., Lerch M., Ullrich A. (1996). Association of human protein-tyrosine phosphatase kappa with members of the armadillo family. J. Biol. Chem. 271: 16712—16719. PMID 8663237 DOI:10.1074/jbc.271.28.16712
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9674 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15262 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9674 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q15262 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]