PTPRA

PTPRA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1P15, 1YFO
Ідентифікатори
Символи	PTPRA, HEPTP, HLPR, HPTPA, HPTPalpha, LRP, PTPA, PTPRL2, R-PTP-alpha, RPTPA, protein tyrosine phosphatase, receptor type A, protein tyrosine phosphatase receptor type A
Зовнішні ІД	OMIM: 176884 MGI: 97808 HomoloGene: 20621 GeneCards: PTPRA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • protein tyrosine phosphatase activity; • phosphoprotein phosphatase activity; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• receptor complex; • integral component of plasma membrane; • integral component of membrane; • мембрана; • екзосома; • клітинна мембрана; • внутрішньоклітинний; • Schaffer collateral - CA1 synapse; • integral component of synaptic membrane;
Біологічний процес	• GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • axon guidance; • protein phosphorylation; • GO:0016576 protein dephosphorylation; • MAPK cascade; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway; • regulation of molecular function; • modulation of chemical synaptic transmission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5786
	19262
	ENSG00000132670
	ENSMUSG00000027303
	P18433; Q5JWG0
	P18052
	NM_080841; NM_002836; NM_080840
	NM_001163688; NM_008980; NM_001355161
	NP_002827; NP_543030; NP_543031
	NP_001157160; NP_033006; NP_001342090
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPRA (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 802 амінокислот, а молекулярна маса — 90 600^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSWFILVLL	GSGLICVSAN	NATTVAPSVG	ITRLINSSTA	EPVKEEAKTS
NPTSSLTSLS	VAPTFSPNIT	LGPTYLTTVN	SSDSDNGTTR	TASTNSIGIT
ISPNGTWLPD	NQFTDARTEP	WEGNSSTAAT	TPETFPPSDE	TPIIAVMVAL
SSLLVIVFII	IVLYMLRFKK	YKQAGSHSNS	KQAGSHSNSF	RLSNGRTEDV
EPQSVPLLAR	SPSTNRKYPP	LPVDKLEEEI	NRRMADDNKL	FREEFNALPA
CPIQATCEAA	SKEENKEKNR	YVNILPYDHS	RVHLTPVEGV	PDSDYINASF
INGYQEKNKF	IAAQGPKEET	VNDFWRMIWE	QNTATIVMVT	NLKERKECKC
AQYWPDQGCW	TYGNIRVSVE	DVTVLVDYTV	RKFCIQQVGD	MTNRKPQRLI
TQFHFTSWPD	FGVPFTPIGM	LKFLKKVKAC	NPQYAGAIVV	HCSAGVGRTG
TFVVIDAMLD	MMHTERKVDV	YGFVSRIRAQ	RCQMVQTDMQ	YVFIYQALLE
HYLYGDTELE	VTSLETHLQK	IYNKIPGTSN	NGLEEEFKKL	TSIKIQNDKM
RTGNLPANMK	KNRVLQIIPY	EFNRVIIPVK	RGEENTDYVN	ASFIDGYRQK
DSYIASQGPL	LHTIEDFWRM	IWEWKSCSIV	MLTELEERGQ	EKCAQYWPSD
GLVSYGDITV	ELKKEEECES	YTVRDLLVTN	TRENKSRQIR	QFHFHGWPEV
GIPSDGKGMI	SIIAAVQKQQ	QQSGNHPITV	HCSAGAGRTG	TFCALSTVLE
RVKAEGILDV	FQTVKSLRLQ	RPHMVQTLEQ	YEFCYKVVQE	YIDAFSDYAN
FK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Sap J., D'Eustachio P., Givol D., Schlessinger J. (1990). Cloning and expression of a widely expressed receptor tyrosine phosphatase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 6112—6116. PMID 2166945 DOI:10.1073/pnas.87.16.6112
Ohagi S., Nishi M., Steiner D.F. (1990). Sequence of a cDNA encoding human LRP (leukocyte common antigen-related peptide). Nucleic Acids Res. 18: 7159—7159. PMID 2175890 DOI:10.1093/nar/18.23.7159
Jirik F.R., Janzen N.M., Melhado I.G., Harder K.W. (1990). Cloning and chromosomal assignment of a widely expressed human receptor-like protein-tyrosine phosphatase. FEBS Lett. 273: 239—242. PMID 2172030 DOI:10.1016/0014-5793(90)81094-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Krueger N.X., Streuli M., Saito H. (1990). Structural diversity and evolution of human receptor-like protein tyrosine phosphatases. EMBO J. 9: 3241—3252. PMID 2170109

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9664 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P18433 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9664 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P18433 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]