PTPN5

PTPN5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2BIJ, 2BV5, 2CJZ
Ідентифікатори
Символи	PTPN5, PTPSTEP, STEP, STEP61, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 5, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 5
Зовнішні ІД	OMIM: 176879 MGI: 97807 HomoloGene: 8423 GeneCards: PTPN5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • phosphotyrosine residue binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein tyrosine phosphatase activity; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • ендоплазматичний ретикулум; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0016576 protein dephosphorylation; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • cellular response to cytokine stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	84867
	19259
	ENSG00000110786
	ENSMUSG00000030854
	P54829
	P54830
NM_001039970; NM_001278236; NM_001278238; NM_001278239; NM_006906;
	NM_032781
	NM_001163565; NM_013643
NP_001035059; NP_001265165; NP_001265167; NP_001265168; NP_008837;
	NP_116170
	NP_001157037; NP_038671
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPN5 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 565 амінокислот, а молекулярна маса — 63 538^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNYEGARSER	ENHAADDSEG	GALDMCCSER	LPGLPQPIVM	EALDEAEGLQ
DSQREMPPPP	PPSPPSDPAQ	KPPPRGAGSH	SLTVRSSLCL	FAASQFLLAC
GVLWFSGYGH	IWSQNATNLV	SSLLTLLKQL	EPTAWLDSGT	WGVPSLLLVF
LSVGLVLVTT	LVWHLLRTPP	EPPTPLPPED	RRQSVSRQPS	FTYSEWMEEK
IEDDFLDLDP	VPETPVFDCV	MDIKPEADPT	SLTVKSMGLQ	ERRGSNVSLT
LDMCTPGCNE	EGFGYLMSPR	EESAREYLLS	ASRVLQAEEL	HEKALDPFLL
QAEFFEIPMN	FVDPKEYDIP	GLVRKNRYKT	ILPNPHSRVC	LTSPDPDDPL
SSYINANYIR	GYGGEEKVYI	ATQGPIVSTV	ADFWRMVWQE	HTPIIVMITN
IEEMNEKCTE	YWPEEQVAYD	GVEITVQKVI	HTEDYRLRLI	SLKSGTEERG
LKHYWFTSWP	DQKTPDRAPP	LLHLVREVEE	AAQQEGPHCA	PIIVHCSAGI
GRTGCFIATS	ICCQQLRQEG	VVDILKTTCQ	LRQDRGGMIQ	TCEQYQFVHH
VMSLYEKQLS	HQSPE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Li X., Luna J., Lombroso P.J., Francke U. (1995). Molecular cloning of the human homolog of a striatum-enriched phosphatase (STEP) gene and chromosomal mapping of the human and murine loci. Genomics. 28: 442—449. PMID 7490079 DOI:10.1006/geno.1995.1173
Mukherjee S., Poddar R., Deb I., Paul S. (2011). Dephosphorylation of specific sites in the kinase-specificity sequence domain leads to ubiquitin-mediated degradation of the tyrosine phosphatase STEP. Biochem. J. 440: 115—125. PMID 21777200 DOI:10.1042/BJ20110240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9657 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P54829 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9657 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P54829 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]