PTGIS

PTGIS (англ. Prostaglandin I2 synthase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 500 амінокислот, а молекулярна маса — 57 104.

PTGIS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3B6H, 2IAG
Ідентифікатори
Символи	PTGIS, CYP8, CYP8A1, PGIS, PTGI, prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase, prostaglandin I2 synthase
Зовнішні ІД	OMIM: 601699 MGI: 1097156 HomoloGene: 37374 GeneCards: PTGIS
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • isomerase activity • зв'язування з іоном металу • monooxygenase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • heme binding • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen • prostaglandin-I synthase activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • caveola • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір Біологічний процес • prostaglandin metabolic process • positive regulation of execution phase of apoptosis • cellular response to interleukin-6 • lipid metabolism • icosanoid metabolic process • cyclooxygenase pathway • fatty acid metabolic process • positive regulation of angiogenesis • fatty acid biosynthetic process • negative regulation of nitric oxide biosynthetic process • decidualization • cellular response to interleukin-1 • positive regulation of peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway • apoptotic signaling pathway • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of inflammatory response • cellular response to hypoxia • embryo implantation • prostaglandin biosynthetic process • NAD biosynthesis via nicotinamide riboside salvage pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5740	19223
Ensembl	ENSG00000124212	н/д
UniProt	Q16647	O35074
RefSeq (мРНК)	NM_000961	NM_008968
RefSeq (білок)	NP_000952	NP_032994
Локус (UCSC)	Хр. 20: 49.5 – 49.57 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAWAALLGLL		AALLLLLLLS		RRRTRRPGEP		PLDLGSIPWL		GYALDFGKDA
ASFLTRMKEK		HGDIFTILVG		GRYVTVLLDP		HSYDAVVWEP		RTRLDFHAYA
IFLMERIFDV		QLPHYSPSDE		KARMKLTLLH		RELQALTEAM		YTNLHAVLLG
DATEAGSGWH		EMGLLDFSYS		FLLRAGYLTL		YGIEALPRTH		ESQAQDRVHS
ADVFHTFRQL		DRLLPKLARG		SLSVGDKDHM		CSVKSRLWKL		LSPARLARRA
HRSKWLESYL		LHLEEMGVSE		EMQARALVLQ		LWATQGNMGP		AAFWLLLFLL
KNPEALAAVR		GELESILWQA		EQPVSQTTTL		PQKVLDSTPV		LDSVLSESLR
LTAAPFITRE		VVVDLAMPMA		DGREFNLRRG		DRLLLFPFLS		PQRDPEIYTD
PEVFKYNRFL		NPDGSEKKDF		YKDGKRLKNY		NMPWGAGHNH		CLGRSYAVNS
IKQFVFLVLV		HLDLELINAD		VEIPEFDLSR		YGFGLMQPEH		DVPVRYRIRP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів, біосинтез простагландинів, метаболізм простагландинів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chiang C.W., Yeh H.C., Wang L.H., Chan N.L. (2006). Crystal structure of the human prostacyclin synthase. J. Mol. Biol. 364: 266—274. PMID 17020766 DOI:10.1016/j.jmb.2006.09.039

Див. також

• Хромосома 20