PTCHD4
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
PTCHD4 (англ. Patched domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 846 амінокислот, а молекулярна маса — 96 371[4].
PTCHD4 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PTCHD4, C6orf138, dJ402H5.2, PTCH53, patched domain containing 4 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 616908 MGI: 1920485 HomoloGene: 78322 GeneCards: PTCHD4 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 47.86 – 48.11 Mb | Хр. 17: 42.63 – 42.82 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MCFLRRPGAP | ASWIWWRMLR | QVLRRGLQSF | CHRLGLCVSR | HPVFFLTVPA | ||||
VLTITFGLSA | LNRFQPEGDL | ERLVAPSHSL | AKIERSLASS | LFPLDQSKSQ | ||||
LYSDLHTPGR | YGRVILLSPT | GDNILLQAEG | ILQTHRAVLE | MKDGRNSFIG | ||||
HQLGGVVEVP | NSKDQRVKSA | RAIQITYYLQ | TYGSATQDLI | GEKWENEFCK | ||||
LIRKLQEEHQ | ELQLYSLASF | SLWRDFHKTS | ILARSKVLVS | LVLILTTATL | ||||
SSSMKDCLRS | KPFLGLLGVL | TVCISIITAA | GIFFITDGKY | NSTLLGIPFF | ||||
AMGHGTKGVF | ELLSGWRRTK | ENLPFKDRIA | DAYSDVMVTY | TMTSSLYFIT | ||||
FGMGASPFTN | IEAVKVFCQN | MCVSILLNYF | YIFSFFGSCL | VFAGQLEQNR | ||||
YHSIFCCKIP | SAEYLDRKPV | WFQTVMSDGH | QQTSHHETNP | YQHHFIQHFL | ||||
REHYNEWITN | IYVKPFVVIL | YLIYASFSFM | GCLQISDGAN | IINLLASDSP | ||||
SVSYAMVQQK | YFSNYSPVIG | FYVYEPLEYW | NSSVQDDLRR | LCSGFTAVSW | ||||
VEQYYQFLKV | SNVSANNKSD | FISVLQSSFL | KKPEFQHFRN | DIIFSKAGDE | ||||
SNIIASRLYL | VARTSRDKQK | EITEVLEKLR | PLSLSKSIRF | IVFNPSFVFM | ||||
DHYSLSVTVP | VLIAGFGVLL | VLILTFFLVI | HPLGNFWLIL | SVTSIELGVL | ||||
GLMTLWNVDM | DCISILCLIY | TLNFAIDHCA | PLLFTFVLAT | EHTRTQCIKS | ||||
SLQDHGTAIL | QNVTSFLIGL | VPLLFVPSNL | TFTLFKCLLL | TGGCTLLHCF | ||||
VILPVFLTFF | PPSKKHHKKK | KRAKRKEREE | IECIEIQENP | DHVTTV |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.
Література
ред.- Chung J.H., Larsen A.R., Chen E., Bunz F. (2014). A PTCH1 homolog transcriptionally activated by p53 suppresses hedgehog signaling. J. Biol. Chem. 289: 33020—33031. PMID 25296753 DOI:10.1074/jbc.M114.597203
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21345 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q6ZW05 (англ.) . Архів оригіналу за 16 листопада 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |