PTCD3

PTCD3 (англ. Pentatricopeptide repeat domain 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 689 амінокислот, а молекулярна маса — 78 550.

PTCD3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3J9M
Ідентифікатори
Символи	PTCD3, MRP-S39, pentatricopeptide repeat domain 3, COXPD51
Зовнішні ІД	OMIM: 614918 MGI: 1917206 HomoloGene: 41211 GeneCards: PTCD3
Онтологія гена Молекулярна функція • rRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ribosomal small subunit binding • RNA binding Клітинна компонента • мітохондріальна внутрішня мембрана • мітохондрія • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • рибосома Біологічний процес • mitochondrial translational elongation • mitochondrial translational termination • regulation of translation • mitochondrial translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55037	69956
Ensembl	ENSG00000132300	ENSMUSG00000063884
UniProt	Q96EY7	Q14C51
RefSeq (мРНК)	NM_017952	NM_027275 NM_001362068 NM_001362069
RefSeq (білок)	NP_060422	NP_081551 NP_001348997 NP_001348998
Локус (UCSC)	Хр. 2: 86.11 – 86.14 Mb	Хр. 6: 71.86 – 71.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVVSAVRWL		GLRSRLGQPL		TGRRAGLCEQ		ARSCRFYSGS		ATLSKVEGTD
VTGIEEVVIP		KKKTWDKVAV		LQALASTVNR		DTTAVPYVFQ		DDPYLMPASS
LESRSFLLAK		KSGENVAKFI		INSYPKYFQK		DIAEPHIPCL		MPEYFEPQIK
DISEAALKER		IELRKVKASV		DMFDQLLQAG		TTVSLETTNS		LLDLLCYYGD
QEPSTDYHFQ		QTGQSEALEE		ENDETSRRKA		GHQFGVTWRA		KNNAERIFSL
MPEKNEHSYC		TMIRGMVKHR		AYEQALNLYT		ELLNNRLHAD		VYTFNALIEA
TVCAINEKFE		EKWSKILELL		RHMVAQKVKP		NLQTFNTILK		CLRRFHVFAR
SPALQVLREM		KAIGIEPSLA		TYHHIIRLFD		QPGDPLKRSS		FIIYDIMNEL
MGKRFSPKDP		DDDKFFQSAM		SICSSLRDLE		LAYQVHGLLK		TGDNWKFIGP
DQHRNFYYSK		FFDLICLMEQ		IDVTLKWYED		LIPSAYFPHS		QTMIHLLQAL
DVANRLEVIP		KIWKDSKEYG		HTFRSDLREE		ILMLMARDKH		PPELQVAFAD
CAADIKSAYE		SQPIRQTAQD		WPATSLNCIA		ILFLRAGRTQ		EAWKMLGLFR
KHNKIPRSEL		LNELMDSAKV		SNSPSQAIEV		VELASAFSLP		ICEGLTQRVM
SDFAINQEQK		EALSNLTALT		SDSDTDSSSD		SDSDTSEGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Amunts A., Brown A., Toots J., Scheres S.H., Ramakrishnan V. (2015). Ribosome. The structure of the human mitochondrial ribosome. Science. 348: 95—98. PMID 25838379 DOI:10.1126/science.aaa1193

Див. також

• Хромосома 2