PSMD9

PSMD9 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 223 амінокислот, а молекулярна маса — 24 682.

PSMD9
Ідентифікатори
Символи	PSMD9, Rpn4, p27, proteasome 26S subunit, non-ATPase 9
Зовнішні ІД	OMIM: 603146 MGI: 1914401 HomoloGene: 2106 GeneCards: PSMD9
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • bHLH transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • proteasome regulatory particle, base subcomplex • proteasome regulatory particle • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • negative regulation of insulin secretion • ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of insulin secretion • protein deubiquitination • посттрансляційна модифікація • proteasome regulatory particle assembly • MAPK cascade • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of cellular amino acid metabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • Fc-epsilon receptor signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • T cell receptor signaling pathway • трансмембранний транспорт • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • interleukin-1-mediated signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition • regulation of hematopoietic stem cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5715	67151
Ensembl	ENSG00000110801	ENSMUSG00000029440
UniProt	O00233	Q9CR00
RefSeq (мРНК)	NM_001261400 NM_002813	NM_026000
RefSeq (білок)	NP_001248329 NP_002804	NP_080276
Локус (UCSC)	Хр. 12: 121.89 – 121.92 Mb	Хр. 5: 123.31 – 123.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDEEARQSG		GSSQAGVVTV		SDVQELMRRK		EEIEAQIKAN		YDVLESQKGI
GMNEPLVDCE		GYPRSDVDLY		QVRTARHNII		CLQNDHKAVM		KQVEEALHQL
HARDKEKQAR		DMAEAHKEAM		SRKLGQSESQ		GPPRAFAKVN		SISPGSPASI
AGLQVDDEIV		EFGSVNTQNF		QSLHNIGSVV		QHSEGKPLNV		TVIRRGEKHQ
LRLVPTRWAG		KGLLGCNIIP		LQR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12