PSMD6

PSMD6 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 389 амінокислот, а молекулярна маса — 45 531.

PSMD6
Ідентифікатори
Символи	PSMD6, Rpn7, S10, SGA-113M, p42A, p44S10, proteasome 26S subunit, non-ATPase 6
Зовнішні ІД	OMIM: 617857 MGI: 1913663 HomoloGene: 7157 GeneCards: PSMD6
Онтологія гена Молекулярна функція • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0010576 enzyme regulator activity Клітинна компонента • гіалоплазма • proteasome accessory complex • proteasome regulatory particle • нуклеоплазма • Протеасома • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen Біологічний процес • протеоліз • protein deubiquitination • neutrophil degranulation • посттрансляційна модифікація • GO:0048552 regulation of catalytic activity • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • MAPK cascade • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of cellular amino acid metabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • Fc-epsilon receptor signaling pathway • regulation of mRNA stability • T cell receptor signaling pathway • трансмембранний транспорт • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • interleukin-1-mediated signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition • regulation of hematopoietic stem cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9861	66413
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000021737
UniProt	Q15008	Q99JI4
RefSeq (мРНК)	NM_001271779 NM_001271780 NM_001271781 NM_014814	NM_025550
RefSeq (білок)	NP_001258708 NP_001258709 NP_001258710 NP_055629	NP_079826
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 14: 8.35 – 8.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPLENLEEEG		LPKNPDLRIA		QLRFLLSLPE		HRGDAAVRDE		LMAAVRDNNM
APYYEALCKS		LDWQIDVDLL		NKMKKANEDE		LKRLDEELED		AEKNLGESEI
RDAMMAKAEY		LCRIGDKEGA		LTAFRKTYDK		TVALGHRLDI		VFYLLRIGLF
YMDNDLITRN		TEKAKSLIEE		GGDWDRRNRL		KVYQGLYCVA		IRDFKQAAEL
FLDTVSTFTS		YELMDYKTFV		TYTVYVSMIA		LERPDLREKV		IKGAEILEVL
HSLPAVRQYL		FSLYECRYSV		FFQSLAVVEQ		EMKKDWLFAP		HYRYYVREMR
IHAYSQLLES		YRSLTLGYMA		EAFGVGVEFI		DQELSRFIAA		GRLHCKIDKV
NEIVETNRPD		SKNWQYQETI		KKGDLLLNRV		QKLSRVINM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Див. також

• Хромосома 3