PSMD5

PSMD5 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 504 амінокислот, а молекулярна маса — 56 196.

PSMD5
Ідентифікатори
Символи	PSMD5, S5B, proteasome 26S subunit, non-ATPase 5
Зовнішні ІД	OMIM: 604452 MGI: 1914248 HomoloGene: 37999 GeneCards: PSMD5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • proteasome regulatory particle, base subcomplex • proteasome accessory complex • нуклеоплазма • Протеасома Біологічний процес • proteasome regulatory particle assembly • proteasome assembly • protein deubiquitination • посттрансляційна модифікація • MAPK cascade • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of cellular amino acid metabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • Fc-epsilon receptor signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • T cell receptor signaling pathway • трансмембранний транспорт • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • interleukin-1-mediated signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition • regulation of hematopoietic stem cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5711	66998
Ensembl	ENSG00000095261	ENSMUSG00000026869
UniProt	Q16401	Q8BJY1
RefSeq (мРНК)	NM_001270427 NM_005047	NM_080554 NM_001355544
RefSeq (білок)	NP_001257356 NP_005038	NP_542121 NP_001342473
Локус (UCSC)	Хр. 9: 120.82 – 120.84 Mb	Хр. 2: 34.74 – 34.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAQALALLR		EVARLEAPLE		ELRALHSVLQ		AVPLNELRQQ		AAELRLGPLF
SLLNENHREK		TTLCVSILER		LLQAMEPVHV		ARNLRVDLQR		GLIHPDDSVK
ILTLSQIGRI		VENSDAVTEI		LNNAELLKQI		VYCIGGENLS		VAKAAIKSLS
RISLTQAGLE		ALFESNLLDD		LKSVMKTNDI		VRYRVYELII		EISSVSPESL
NYCTTSGLVT		QLLRELTGED		VLVRATCIEM		VTSLAYTHHG		RQYLAQEGVI
DQISNIIVGA		DSDPFSSFYL		PGFVKFFGNL		AVMDSPQQIC		ERYPIFVEKV
FEMIESQDPT		MIGVAVDTVG		ILGSNVEGKQ		VLQKTGTRFE		RLLMRIGHQS
KNAPVELKIR		CLDAISSLLY		LPPEQQTDDL		LRMTESWFSS		LSRDPLELFR
GISSQPFPEL		HCAALKVFTA		IANQPWAQKL		MFNSPGFVEY		VVDRSVEHDK
ASKDAKYELV		KALANSKTIA		EIFGNPNYLR		LRTYLSEGPY		YVKPVSTTAV
EGAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• Deveraux Q., Jensen C., Rechsteiner M. (1995). Molecular cloning and expression of a 26 S protease subunit enriched in dileucine repeats. J. Biol. Chem. 270: 23726—23729. PMID 7559544 DOI:10.1074/jbc.270.40.23726
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Le Tallec B., Barrault M.B., Guerois R., Carre T., Peyroche A. (2009). Hsm3/S5b participates in the assembly pathway of the 19S regulatory particle of the proteasome. Mol. Cell. 33: 389—399. PMID 19217412 DOI:10.1016/j.molcel.2009.01.010

Див. також

• Хромосома 9