PSMB9

PSMB9
Ідентифікатори
Символи	PSMB9, LMP2, PSMB6i, RING12, beta1i, proteasome subunit beta 9, PRAAS3, proteasome 20S subunit beta 9
Зовнішні ІД	OMIM: 177045 MGI: 1346526 HomoloGene: 2094 GeneCards: PSMB9
Онтологія гена
Молекулярна функція	• endopeptidase activity; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • threonine-type endopeptidase activity; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• spermatoproteasome complex; • нуклеоплазма; • Протеасома; • екзосома; • клітинне ядро; • proteasome core complex; • цитоплазма; • гіалоплазма; • proteasome core complex, beta-subunit complex;
Біологічний процес	• regulation of cellular amino acid metabolic process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • regulation of mRNA stability; • regulation of cysteine-type endopeptidase activity; • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; • процес імунної системи; • protein polyubiquitination; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • MAPK cascade; • протеоліз; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • NIK/NF-kappaB signaling; • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • T cell receptor signaling pathway; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • GO:0022415 viral process; • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • protein deubiquitination; • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • трансмембранний транспорт; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; • посттрансляційна модифікація; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation; • proteasomal protein catabolic process; • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • regulation of mitotic cell cycle phase transition;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5698
	16912
ENSG00000240118; ENSG00000243067; ENSG00000240065; ENSG00000240508; ENSG00000242711;
	ENSG00000243594; ENSG00000243958; ENSG00000239836
	ENSMUSG00000096727
	P28065
	P28076
	NM_002800; NM_148954
	NM_013585
	NP_002791
	NP_038613
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PSMB9 (англ. Proteasome subunit beta 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 23 264^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLRAGAPTGD	LPRAGEVHTG	TTIMAVEFDG	GVVMGSDSRV	SAGEAVVNRV
FDKLSPLHER	IYCALSGSAA	DAQAVADMAA	YQLELHGIEL	EEPPLVLAAA
NVVRNISYKY	REDLSAHLMV	AGWDQREGGQ	VYGTLGGMLT	RQPFAIGGSG
STFIYGYVDA	AYKPGMSPEE	CRRFTTDAIA	LAMSRDGSSG	GVIYLVTITA
AGVDHRVILG	NELPKFYDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Singal D.P., Ye M., Quadri S.A. (1995). Major histocompatibility-encoded human proteasome LMP2. Genomic organization and a new form of mRNA. J. Biol. Chem. 270: 1966—1970. PMID 7829535 DOI:10.1074/jbc.270.4.1966
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gaczynska M., Goldberg A.L., Tanaka K., Hendil K.B., Rock K.L. (1996). Proteasome subunits X and Y alter peptidase activities in opposite ways to the interferon-gamma-induced subunits LMP2 and LMP7. J. Biol. Chem. 271: 17275—17280. PMID 8663318 DOI:10.1074/jbc.271.29.17275
Li J., Schuler-Thurner B., Schuler G., Huber C., Seliger B. (2001). Bipartite regulation of different components of the MHC class I antigen-processing machinery during dendritic cell maturation. Int. Immunol. 13: 1515—1523. PMID 11717192 DOI:10.1093/intimm/13.12.1515
Raghavendra Prasad H.S., Qi Z., Srinivasan K.N., Gopalakrishnakone P. (2004). Potential effects of tetrodotoxin exposure to human glial cells postulated using microarray approach. Toxicon. 44: 597—608. PMID 15501285 DOI:10.1016/j.toxicon.2004.07.018
Callahan M.K., Wohlfert E.A., Menoret A., Srivastava P.K. (2006). Heat shock up-regulates lmp2 and lmp7 and enhances presentation of immunoproteasome-dependent epitopes. J. Immunol. 177: 8393—8399. PMID 17142736 DOI:10.4049/jimmunol.177.12.8393

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9546 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P28065 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9546 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P28065 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]