PSMB7

PSMB7 (англ. Proteasome subunit beta 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 29 965.

PSMB7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4R3O, 4R67, 5A0Q
Ідентифікатори
Символи	PSMB7, proteasome subunit beta 7, Z, proteasome 20S subunit beta 7
Зовнішні ІД	OMIM: 604030 MGI: 107637 HomoloGene: 2093 GeneCards: PSMB7
Онтологія гена Молекулярна функція • endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • threonine-type endopeptidase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • Протеасома • екзосома • клітинне ядро • proteasome core complex • extracellular region • цитоплазма • гіалоплазма • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • proteasome core complex, beta-subunit complex Біологічний процес • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of mRNA stability • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • протеоліз • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0022415 viral process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • neutrophil degranulation • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • proteasomal protein catabolic process • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5695	19177
Ensembl	ENSG00000136930	ENSMUSG00000026750
UniProt	Q99436 Q5TBG5	P70195
RefSeq (мРНК)	NM_002799	NM_011187
RefSeq (білок)	NP_002790	NP_035317
Локус (UCSC)	Хр. 9: 124.35 – 124.42 Mb	Хр. 2: 38.48 – 38.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVSVYAPP		VGGFSFDNCR		RNAVLEADFA		KRGYKLPKVR		KTGTTIAGVV
YKDGIVLGAD		TRATEGMVVA		DKNCSKIHFI		SPNIYCCGAG		TAADTDMTTQ
LISSNLELHS		LSTGRLPRVV		TANRMLKQML		FRYQGYIGAA		LVLGGVDVTG
PHLYSIYPHG		STDKLPYVTM		GSGSLAAMAV		FEDKFRPDME		EEEAKNLVSE
AIAAGIFNDL		GSGSNIDLCV		ISKNKLDFLR		PYTVPNKKGT		RLGRYRCEKG
TTAVLTEKIT		PLEIEVLEET		VQTMDTS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yano M., Koumoto Y., Kanesaki Y., Wu X., Kido H. (2004). 20S proteasome prevents aggregation of heat-denatured proteins without PA700 regulatory subcomplex like a molecular chaperone. Biomacromolecules. 5: 1465—1469. PMID 15244466 DOI:10.1021/bm049957a
• Rho J.H., Qin S., Wang J.Y., Roehrl M.H. (2008). Proteomic expression analysis of surgical human colorectal cancer tissues: up-regulation of PSB7, PRDX1, and SRP9 and hypoxic adaptation in cancer. J. Proteome Res. 7: 2959—2972. PMID 18549262 DOI:10.1021/pr8000892
• Rut W., Drag M. (2016). Human 20S proteasome activity towards fluorogenic peptides of various chain lengths. Biol. Chem. 397: 921—926. PMID 27176742 DOI:10.1515/hsz-2016-0176
• da Fonseca P.C., Morris E.P. (2015). Cryo-EM reveals the conformation of a substrate analogue in the human 20S proteasome core. Nat. Commun. 6: 7573—7573. PMID 26133119 DOI:10.1038/ncomms8573
• Harshbarger W., Miller C., Diedrich C., Sacchettini J. (2015). Crystal structure of the human 20S proteasome in complex with carfilzomib. Structure. 23: 418—424. PMID 25599644 DOI:10.1016/j.str.2014.11.017

Див. також

• Хромосома 9