PSMB6

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

PSMB6 (англ. Proteasome subunit beta 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 239 амінокислот, а молекулярна маса — 25 358[5].

PSMB6
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PSMB6, DELTA, LMPY, proteasome subunit beta 6, Y, proteasome 20S subunit beta 6
Зовнішні ІД OMIM: 600307 MGI: 104880 HomoloGene: 2092 GeneCards: PSMB6
Реагує на сполуку
Карфілзоміб, ixazomib, Oprozomib[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_002798
NM_001270481
NM_008946
RefSeq (білок)
NP_001257410
NP_002789
NP_032972
Локус (UCSC) Хр. 17: 4.8 – 4.8 Mb Хр. 11: 70.42 – 70.42 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAATLLAARGAGPAPAWGPEAFTPDWESREVSTGTTIMAVQFDGGVVLGA
DSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFH
SIELNEPPLVHTAASLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPM
GGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLQFTANALALAMER
DGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKFAVATLPPA

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

ред.
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Yano M., Koumoto Y., Kanesaki Y., Wu X., Kido H. (2004). 20S proteasome prevents aggregation of heat-denatured proteins without PA700 regulatory subcomplex like a molecular chaperone. Biomacromolecules. 5: 1465—1469. PMID 15244466 DOI:10.1021/bm049957a
  • Rut W., Drag M. (2016). Human 20S proteasome activity towards fluorogenic peptides of various chain lengths. Biol. Chem. 397: 921—926. PMID 27176742 DOI:10.1515/hsz-2016-0176
  • da Fonseca P.C., Morris E.P. (2015). Cryo-EM reveals the conformation of a substrate analogue in the human 20S proteasome core. Nat. Commun. 6: 7573—7573. PMID 26133119 DOI:10.1038/ncomms8573
  • Harshbarger W., Miller C., Diedrich C., Sacchettini J. (2015). Crystal structure of the human 20S proteasome in complex with carfilzomib. Structure. 23: 418—424. PMID 25599644 DOI:10.1016/j.str.2014.11.017
  • Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Примітки

ред.

Див. також

ред.