PSD (ген)

PSD (англ. Pleckstrin and Sec7 domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 024 амінокислот, а молекулярна маса — 109 543.

PSD
Ідентифікатори
Символи	PSD, EFA6, EFA6A, PSD1, TYL, pleckstrin and Sec7 domain containing
Зовнішні ІД	OMIM: 602327 MGI: 1920978 HomoloGene: 31115 GeneCards: PSD
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phospholipid binding • signal transducer activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • клітинна мембрана • cell projection • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • dendritic spine • extrinsic component of postsynaptic endosome membrane • Борозна розщеплення • ruffle membrane • postsynaptic density, intracellular component Біологічний процес • regulation of ARF protein signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • neuron projection development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5662	73728
Ensembl	ENSG00000059915	ENSMUSG00000037126
UniProt	Q86YI3	Q5DTT2
RefSeq (мРНК)	NM_001270965 NM_001270966 NM_002779	NM_028627 NM_001347454
RefSeq (білок)	NP_001257894 NP_001257895 NP_002770 NP_001257895.1	NP_001334383 NP_082903
Локус (UCSC)	Хр. 10: 102.4 – 102.42 Mb	Хр. 19: 46.31 – 46.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQGAMRFCS		EGDCAISPPR		CPRRWLPEGP		VPQSPPASMY		GSTGSLLRRV
AGPGPRGREL		GRVTAPCTPL		RGPPSPRVAP		SPWAPSSPTG		QPPPGAQSSV
VIFRFVEKAS		VRPLNGLPAP		GGLSRSWDLG		GVSPPRPTPA		LGPGSNRKLR
LEASTSDPLP		ARGGSALPGS		RNLVHGPPAP		PQVGADGLYS		SLPNGLGGPP
ERLATLFGGP		ADTGFLNQGD		TWSSPREVSS		HAQRIARAKW		EFFYGSLDPP
SSGAKPPEQA		PPSPPGVGSR		QGSGVAVGRA		AKYSETDLDT		VPLRCYRETD
IDEVLAEREE		ADSAIESQPS		SEGPPGTAYP		PAPRPGPLPG		PHPSLGSGNE
DEDDDEAGGE		EDVDDEVFEA		SEGARPGSRM		PLKSPVPFLP		GTSPSADGPD
SFSCVFEAIL		ESHRAKGTSY		TSLASLEALA		SPGPTQSPFF		TFELPPQPPA
PRPDPPAPAP		LAPLEPDSGT		SSAADGPWTQ		RGEEEEAEAR		AKLAPGREPP
SPCHSEDSLG		LGAAPLGSEP		PLSQLVSDSD		SELDSTERLA		LGSTDTLSNG
QKADLEAAQR		LAKRLYRLDG		FRKADVARHL		GKNNDFSKLV		AGEYLKFFVF
TGMTLDQALR		VFLKELALMG		ETQERERVLA		HFSQRYFQCN		PEALSSEDGA
HTLTCALMLL		NTDLHGHNIG		KRMTCGDFIG		NLEGLNDGGD		FPRELLKALY
SSIKNEKLQW		AIDEEELRRS		LSELADPNPK		VIKRISGGSG		SGSSPFLDLT
PEPGAAVYKH		GALVRKVHAD		PDCRKTPRGK		RGWKSFHGIL		KGMILYLQKE
EYKPGKALSE		TELKNAISIH		HALATRASDY		SKRPHVFYLR		TADWRVFLFQ
APSLEQMQSW		ITRINVVAAM		FSAPPFPAAV		SSQKKFSRPL		LPSAATRLSQ
EEQVRTHEAK		LKAMASELRE		HRAAQLGKKG		RGKEAEEQRQ		KEAYLEFEKS
RYSTYAALLR		VKLKAGSEEL		DAVEAALAQA		GSTEDGLPPS		HSSPSLQPKP
SSQPRAQRHS		SEPRPGAGSG		RRKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 10