PRRT3

PRRT3 (англ. Proline rich transmembrane protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 981 амінокислот, а молекулярна маса — 102 197.

PRRT3
Ідентифікатори
Символи	PRRT3, proline rich transmembrane protein 3
Зовнішні ІД	MGI: 2444810 HomoloGene: 52099 GeneCards: PRRT3
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	285368	210673
Ensembl	ENSG00000163704	ENSMUSG00000045009
UniProt	Q5FWE3	Q6PE13
RefSeq (мРНК)	NM_207351 NM_001318871	NM_001289699 NM_001289700 NM_172487
RefSeq (білок)	NP_001305800 NP_997234	NP_001276628 NP_001276629 NP_766075
Локус (UCSC)	Хр. 3: 9.95 – 9.95 Mb	Хр. 6: 113.47 – 113.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSPWGCVC		GLLLLLLPLL		GTGPALGRGF		PRPLENSEIP		MIPGAHPKGS
VGSEPQAFDV		FPENPRADSH		RNSDVRHAPA		EEMPEKPVAS		PLGPALYGPK
AAQGAQRERL		PVTDDLQMAQ		GPSSHGWTGP		LDSQELLQQE		AVAPHPVGHP
HLTFIPTTPR		RQLRVATVPP		SLQHEGQEGQ		WPPRDEGLKA		KTKSRVPPTS
PSDHQGPPHT		LVSHSGTVKR		PVLEGQGGFE		EHLQEAAQGP		HFTQQDPAAP
DVGSVPPVEV		VYSQEPGAQP		DLALARSLPP		AEELPVETPK		RAGAEVSWEV
SSPGPPPKQA		DLPDAKDSPG		PQPTDPPASE		APDRPSKPER		AAMNGADPIS
PQRVRGAVEA		PGTPKSLIPG		PSDPGPAVNR		TESPMGALQP		DEAEEWPGRP
QSHPPAPPVQ		APSTSRRGLI		RVTTQRALGQ		PPPPEPTASS		MASAPASSPP
ANATAPPLRW		GPLRRVLSFS		WELHVYGVGV		LFLLPALLAL		AALAAAPAGP
RLALVAAVLV		LVASALRSAY		MLTDPYGSQA		RLGVRGGLVL		YNLPFPLLLT
ALAALTLLGL		GAGLPPPLQN		PLLLGAVALV		HGVGLLATDL		LSTWSVLNLL
TQGLSCAWGA		AVALGTLCLC		RRRLLDGPRG		WDASPGPRLL		AVAGALGLLA
SGLQLAAALW		LYPGPGRVGR		FSWAWWGVHF		WLRLLELTWA		LALALAAVAA
ARPRPPTEHA		CWAKLMRLAC		PAPSGKSEVP		ERPNNCYAGP		SNVGAGSLDI
SKSLIRNPAE		SGQLATPSSG		AWGSAASLGR		GPQGGPGLSR		NGVGPAPSLS
ELDLRPPSPI		NLSRSIDAAL		FREHLVRDSV		FQRCGLRGLA		SPPPGGALRP
RRGSHPKAEL		DDAGSSLLRG		RCRSLSDVRV		RGPVPQHVVE		APDGAAAAAS
GSSLDSFSRG		SLKISWNPWR		HGLSSVDSLP		LDELPSTVQL		LPAPTPAPDS
TAARQGDGQG		EVQPRGKPGE		SRSASSDTIE		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Див. також

• Хромосома 3