PRRT1

PRRT1 (англ. Proline rich transmembrane protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 306 амінокислот, а молекулярна маса — 31 430.

PRRT1
Ідентифікатори
Символи	PRRT1, C6orf31, DSPD1, IFITMD7, NG5, proline rich transmembrane protein 1, SynDIG4
Зовнішні ІД	OMIM: 618297 MGI: 1932118 HomoloGene: 137397 GeneCards: PRRT1
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80863	260297
Ensembl	ENSG00000225141 ENSG00000204314 ENSG00000229071 ENSG00000235956 ENSG00000206331 ENSG00000227122 ENSG00000238056 ENSG00000229488	ENSMUSG00000015476
UniProt	Q99946	O35449
RefSeq (мРНК)	NM_030651 NM_001363780	NM_030890 NM_001368728 NM_001368729 NM_001368730
RefSeq (білок)	NP_085154 NP_001350709	NP_112152 NP_001355657 NP_001355658 NP_001355659
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.15 – 32.15 Mb	Хр. 17: 34.85 – 34.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSEKSGLPD		SVPHTSPPPY		NAPQPPAEPP		APPPQAAPSS		HHHHHHHYHQ
SGTATLPRLG		AGGLASSAAT		AQRGPSSSAT		LPRPPHHAPP		GPAAGAPPPG
CATLPRMPPD		PYLQETRFEG		PLPPPPPAAA		APPPPAPAQT		AQAPGFVVPT
HAGTVGTLPL		GGYVAPGYPL		QLQPCTAYVP		VYPVGTPYAG		GTPGGTGVTS
TLPPPPQGPG		LALLEPRRPP		HDYMPIAVLT		TICCFWPTGI		IAIFKAVQVR
TALARGDMVS		AEIASREARN		FSFISLAVGI		AAMVLCTILT		VVIIIAAQHH
ENYWDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sallman Almen M., Bringeland N., Fredriksson R., Schioth H.B. (2012). The dispanins: a novel gene family of ancient origin that contains 14 human members. PLoS ONE. 7: E31961—E31961. PMID 22363774 DOI:10.1371/journal.pone.0031961

Див. також

• Хромосома 6