PRPF40B

PRPF40B
Ідентифікатори
Символи	PRPF40B, HYPC, pre-mRNA processing factor 40 homolog B
Зовнішні ІД	MGI: 1925583 HomoloGene: 81828 GeneCards: PRPF40B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding;
Клітинна компонента	• U1 snRNP; • nuclear speck; • U2-type prespliceosome; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA processing; • Сплайсинг РНК; • mRNA cis splicing, via spliceosome;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	25766
	54614
	ENSG00000110844
	ENSMUSG00000023007
	Q6NWY9
	Q80W14
NM_001031698; NM_012272; NM_001363607; NM_001379030; NM_001379031;
	NM_001379032; NM_001379033; NM_001379034; NM_001379035; NM_001379036; NM_001379037
	NM_018786; NM_001348256
NP_001026868; NP_036404; NP_001350536; NP_001365959; NP_001365960;
	NP_001365961; NP_001365962; NP_001365963; NP_001365964; NP_001365965; NP_001365966
NP_061256; NP_001335185; NP_001357561; NP_001357562; NP_001357563;
	NP_001357564
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRPF40B (англ. Pre-mRNA processing factor 40 homolog B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 871 амінокислот, а молекулярна маса — 99 358^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMPPPFMPPP	GIPPPFPPMG	LPPMSQRPPA	IPPMPPGILP	PMLPPMGAPP
PLTQIPGMVP	PMMPGMLMPA	VPVTAATAPG	ADTASSAVAG	TGPPRALWSE
HVAPDGRIYY	YNADDKQSVW	EKPSVLKSKA	ELLLSQCPWK	EYKSDTGKPY
YYNNQSKESR	WTRPKDLDDL	EVLVKQEAAG	KQQQQLPQTL	QPQPPQPQPD
PPPVPPGPTP	VPTGLLEPEP	GGSEDCDVLE	ATQPLEQGFL	QQLEEGPSSS
GQHQPQQEEE	ESKPEPERSG	LSWSNREKAK	QAFKELLRDK	AVPSNASWEQ
AMKMVVTDPR	YSALPKLSEK	KQAFNAYKAQ	REKEEKEEAR	LRAKEAKQTL
QHFLEQHERM	TSTTRYRRAE	QTFGELEVWA	VVPERDRKEV	YDDVLFFLAK
KEKEQAKQLR	RRNIQALKSI	LDGMSSVNFQ	TTWSQAQQYL	MDNPSFAQDH
QLQNMDKEDA	LICFEEHIRA	LEREEEEERE	RARLRERRQQ	RKNREAFQTF
LDELHETGQL	HSMSTWMELY	PAVSTDVRFA	NMLGQPGSTP	LDLFKFYVEE
LKARFHDEKK	IIKDILKDRG	FCVEVNTAFE	DFAHVISFDK	RAAALDAGNI
KLTFNSLLEK	AEAREREREK	EEARRMRRRE	AAFRSMLRQA	VPALELGTAW
EEVRERFVCD	SAFEQITLES	ERIRLFREFL	QVLEQTECQH	LHTKGRKHGR
KGKKHHHKRS	HSPSGSESEE	EELPPPSLRP	PKRRRRNPSE	SGSEPSSSLD
SVESGGAALG	GRGSPSSHLL	GADHGLRKAK	KPKKKTKKRR	HKSNSPESET
DPEEKAGKES	DEKEQEQDKD	RELQQAELPN	RSPGFGIKKE	KTGWDTSESE
LSEGELERRR	RTLLQQLDDH	Q

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25031 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6NWY9 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25031 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q6NWY9 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]