PRPF40A

PRPF40A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1UZC, 1YWI, 1YWJ, 1ZR7, 2CQN, 2DYF, 2KZG, 2L5F, 2L9V, 2LKS
Ідентифікатори
Символи	PRPF40A, FBP-11, FBP11, FLAF1, FNBP3, HIP-10, HIP10, HYPA, NY-REN-6, Prp40, pre-mRNA processing factor 40 homolog A
Зовнішні ІД	OMIM: 612941 MGI: 1860512 HomoloGene: 6377 GeneCards: PRPF40A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• proline-rich region binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• nuclear matrix; • U1 snRNP; • U2-type prespliceosome; • мембрана; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • nuclear speck;
Біологічний процес	• поділ клітини; • клітинний цикл; • mRNA processing; • regulation of cytokinesis; • cell migration; • cytoskeleton organization; • Сплайсинг РНК; • regulation of cell shape; • mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA cis splicing, via spliceosome;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	55660
	56194
	ENSG00000196504
	ENSMUSG00000061136
	O75400
	Q9R1C7
NM_017892; NM_001354432; NM_001354431; NM_001365596; NM_001365597;
	NM_001365598; NM_001365599; NM_001365600; NM_001365601; NM_001365602; NM_001365603; NM_001365604; NM_001365605; NM_001395472; NM_001395473; NM_001395475; NM_001395476; NM_001395477; NM_001395478; NM_001395479; NM_001395480; NM_001395481; NM_001395482; NM_001395483; NM_001395488
	NM_018785
NP_060362; NP_001341361; NP_001341360; NP_001352525; NP_001352526;
	NP_001352527; NP_001352528; NP_001352529; NP_001352530; NP_001352531; NP_001352532; NP_001352533; NP_001352534
NP_061255; NP_001357944; NP_001357945; NP_001357946; NP_001357947;
	NP_001357948; NP_001357949
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRPF40A (англ. Pre-mRNA processing factor 40 homolog A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 957 амінокислот, а молекулярна маса — 108 805^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRPGTGAERG	GLMVSEMESH	PPSQGPGDGE	RRLSGSSLCS	GSWVSADGFL
RRRPSMGHPG	MHYAPMGMHP	MGQRANMPPV	PHGMMPQMMP	PMGGPPMGQM
PGMMSSVMPG	MMMSHMSQAS	MQPALPPGVN	SMDVAAGTAS	GAKSMWTEHK
SPDGRTYYYN	TETKQSTWEK	PDDLKTPAEQ	LLSKCPWKEY	KSDSGKPYYY
NSQTKESRWA	KPKELEDLEG	YQNTIVAGSL	ITKSNLHAMI	KAEESSKQEE
CTTTSTAPVP	TTEIPTTMST	MAAAEAAAAV	VAAAAAAAAA	AAAANANAST
SASNTVSGTV	PVVPEPEVTS	IVATVVDNEN	TVTISTEEQA	QLTSTPAIQD
QSVEVSSNTG	EETSKQETVA	DFTPKKEEEE	SQPAKKTYTW	NTKEEAKQAF
KELLKEKRVP	SNASWEQAMK	MIINDPRYSA	LAKLSEKKQA	FNAYKVQTEK
EEKEEARSKY	KEAKESFQRF	LENHEKMTST	TRYKKAEQMF	GEMEVWNAIS
ERDRLEIYED	VLFFLSKKEK	EQAKQLRKRN	WEALKNILDN	MANVTYSTTW
SEAQQYLMDN	PTFAEDEELQ	NMDKEDALIC	FEEHIRALEK	EEEEEKQKSL
LRERRRQRKN	RESFQIFLDE	LHEHGQLHSM	SSWMELYPTI	SSDIRFTNML
GQPGSTALDL	FKFYVEDLKA	RYHDEKKIIK	DILKDKGFVV	EVNTTFEDFV
AIISSTKRST	TLDAGNIKLA	FNSLLEKAEA	REREREKEEA	RKMKRKESAF
KSMLKQAAPP	IELDAVWEDI	RERFVKEPAF	EDITLESERK	RIFKDFMHVL
EHECQHHHSK	NKKHSKKSKK	HHRKRSRSRS	GSDSDDDDSH	SKKKRQRSES
RSASEHSSSA	ESERSYKKSK	KHKKKSKKRR	HKSDSPESDA	EREKDKKEKD
RESEKDRTRQ	RSESKHKSPK	KKTGKDSGNW	DTSGSELSEG	ELEKRRRTLL
EQLDDDQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, клітинний цикл, поділ клітини, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Allen M., Friedler A., Schon O., Bycroft M. (2002). The structure of an FF domain from human HYPA/FBP11. J. Mol. Biol. 323: 411—416. PMID 12381297 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00968-3
Sayer J.A., Manczak M., Akileswaran L., Reddy P.H., Coghlan V.M. (2005). Interaction of the nuclear matrix protein NAKAP with HypA and huntingtin: implications for nuclear toxicity in Huntington's disease pathogenesis. NeuroMolecular Med. 7: 297—310. PMID 16391387 DOI:10.1385/NMM:7:4:297

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16463 (англ.) . Архів оригіналу за 30 травня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, O75400 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16463 (англ.) . Архів оригіналу за 30 травня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O75400 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]