PRKD1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
PRKD1 (англ. Protein kinase D1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 912 амінокислот, а молекулярна маса — 101 704[6].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSAPPVLRPP | SPLLPVAAAA | AAAAAALVPG | SGPGPAPFLA | PVAAPVGGIS | ||||
FHLQIGLSRE | PVLLLQDSSG | DYSLAHVREM | ACSIVDQKFP | ECGFYGMYDK | ||||
ILLFRHDPTS | ENILQLVKAA | SDIQEGDLIE | VVLSASATFE | DFQIRPHALF | ||||
VHSYRAPAFC | DHCGEMLWGL | VRQGLKCEGC | GLNYHKRCAF | KIPNNCSGVR | ||||
RRRLSNVSLT | GVSTIRTSSA | ELSTSAPDEP | LLQKSPSESF | IGREKRSNSQ | ||||
SYIGRPIHLD | KILMSKVKVP | HTFVIHSYTR | PTVCQYCKKL | LKGLFRQGLQ | ||||
CKDCRFNCHK | RCAPKVPNNC | LGEVTINGDL | LSPGAESDVV | MEEGSDDNDS | ||||
ERNSGLMDDM | EEAMVQDAEM | AMAECQNDSG | EMQDPDPDHE | DANRTISPST | ||||
SNNIPLMRVV | QSVKHTKRKS | STVMKEGWMV | HYTSKDTLRK | RHYWRLDSKC | ||||
ITLFQNDTGS | RYYKEIPLSE | ILSLEPVKTS | ALIPNGANPH | CFEITTANVV | ||||
YYVGENVVNP | SSPSPNNSVL | TSGVGADVAR | MWEIAIQHAL | MPVIPKGSSV | ||||
GTGTNLHRDI | SVSISVSNCQ | IQENVDISTV | YQIFPDEVLG | SGQFGIVYGG | ||||
KHRKTGRDVA | IKIIDKLRFP | TKQESQLRNE | VAILQNLHHP | GVVNLECMFE | ||||
TPERVFVVME | KLHGDMLEMI | LSSEKGRLPE | HITKFLITQI | LVALRHLHFK | ||||
NIVHCDLKPE | NVLLASADPF | PQVKLCDFGF | ARIIGEKSFR | RSVVGTPAYL | ||||
APEVLRNKGY | NRSLDMWSVG | VIIYVSLSGT | FPFNEDEDIH | DQIQNAAFMY | ||||
PPNPWKEISH | EAIDLINNLL | QVKMRKRYSV | DKTLSHPWLQ | DYQTWLDLRE | ||||
LECKIGERYI | THESDDLRWE | KYAGEQGLQY | PTHLINPSAS | HSDTPETEET | ||||
EMKALGERVS | IL |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, ангіогенез, диференціація клітин, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.
Література
ред.- Bagowski C.P., Stein-Gerlach M., Choidas A., Ullrich A. (1999). Cell-type specific phosphorylation of threonines T654 and T669 by PKD defines the signal capacity of the EGF receptor. EMBO J. 18: 5567—5576. PMID 10523301 DOI:10.1093/emboj/18.20.5567
- Storz P., Toker A. (2003). Protein kinase D mediates a stress-induced NF-kappaB activation and survival pathway. EMBO J. 22: 109—120. PMID 12505989 DOI:10.1093/emboj/cdg009
- Storz P., Doppler H., Johannes F.J., Toker A. (2003). Tyrosine phosphorylation of protein kinase D in the pleckstrin homology domain leads to activation. J. Biol. Chem. 278: 17969—17976. PMID 12637538 DOI:10.1074/jbc.M213224200
- Storz P., Doppler H., Toker A. (2004). Protein kinase Cdelta selectively regulates protein kinase D-dependent activation of NF-kappaB in oxidative stress signaling. Mol. Cell. Biol. 24: 2614—2626. PMID 15024053 DOI:10.1128/MCB.24.7.2614-2626.2004
- Eisenberg-Lerner A., Kimchi A. (2007). DAP kinase regulates JNK signaling by binding and activating protein kinase D under oxidative stress. Cell Death Differ. 14: 1908—1915. PMID 17703233 DOI:10.1038/sj.cdd.4402212
- Doppler H., Storz P. (2007). A novel tyrosine phosphorylation site in protein kinase D contributes to oxidative stress-mediated activation. J. Biol. Chem. 282: 31873—31881. PMID 17804414 DOI:10.1074/jbc.M703584200
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRKD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Protein kinase D1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9407 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q15139 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |