PRKAA1

PRKAA1 (англ. Protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 559 амінокислот, а молекулярна маса — 64 009.

PRKAA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4RED, 4RER, 4REW, 5EZV
Ідентифікатори
Символи	PRKAA1, AMPK, AMPKa1, Protein kinase, AMP-activated, alpha 1, protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602739 MGI: 2145955 HomoloGene: 49590 GeneCards: PRKAA1
шифр КФ	2.7.11.26
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • cAMP-dependent protein kinase activity • [acetyl-CoA carboxylase kinase activity] • AMP-activated protein kinase activity • histone serine kinase activity • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • tau-protein kinase activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • [hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH) kinase activity] • ATP binding • tau protein binding Клітинна компонента • nucleotide-activated protein kinase complex • apical plasma membrane • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • внутрішньоклітинний • аксон • дендрит (нейробіологія) • GO:0009327 protein-containing complex • neuronal cell body Біологічний процес • cellular response to organonitrogen compound • steroid metabolic process • cellular response to glucose starvation • sterol biosynthetic process • lipid biosynthetic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to hypoxia • cellular response to ethanol • glucose homeostasis • positive regulation of skeletal muscle tissue development • protein heterooligomerization • ритмічний процес • фосфорилювання • lipid metabolism • regulation of vesicle-mediated transport • negative regulation of apoptotic process • cholesterol metabolic process • Wnt signaling pathway • response to activity • fatty acid metabolic process • transcription, DNA-templated • cellular response to prostaglandin E stimulus • автофагія • protein phosphorylation • negative regulation of TOR signaling • cold acclimation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • response to camptothecin • fatty acid biosynthetic process • fatty acid homeostasis • regulation of circadian rhythm • fatty acid oxidation • regulation of peptidyl-serine phosphorylation • cellular response to nutrient levels • positive regulation of cell population proliferation • negative regulation of glucosylceramide biosynthetic process • glucose metabolic process • positive regulation of cholesterol biosynthetic process • response to caffeine • cholesterol biosynthetic process • negative regulation of lipid catabolic process • response to gamma radiation • macroautophagy • response to UV • positive regulation of glycolytic process • response to hydrogen peroxide • cellular response to hypoxia • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to hydrogen peroxide • steroid biosynthetic process • regulation of signal transduction by p53 class mediator • positive regulation of autophagy • CAMKK-AMPK signaling cascade • regulation of macroautophagy • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of mitochondrial transcription • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • negative regulation of gene expression • cellular response to oxidative stress • GO:0007243 intracellular signal transduction • GO:1903105 negative regulation of insulin receptor signaling pathway • motor behavior • regulation of stress granule assembly • neuron cellular homeostasis • regulation of microtubule cytoskeleton organization • cellular response to calcium ion • cellular response to glucose stimulus • energy homeostasis • positive regulation of protein localization • negative regulation of tubulin deacetylation • positive regulation of peptidyl-lysine acetylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5562	105787
Ensembl	ENSG00000132356	ENSMUSG00000050697
UniProt	Q13131	Q5EG47
RefSeq (мРНК)	NM_006251 NM_206907	NM_001013367 NM_001355640
RefSeq (білок)	NP_006242 NP_996790 NP_001341957 NP_001341958 NP_001341963 NP_001341964 NP_001341965 NP_001341966	NP_001013385 NP_001342569
Локус (UCSC)	Хр. 5: 40.76 – 40.8 Mb	Хр. 15: 5.17 – 5.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRLSSWRKM		ATAEKQKHDG		RVKIGHYILG		DTLGVGTFGK		VKVGKHELTG
HKVAVKILNR		QKIRSLDVVG		KIRREIQNLK		LFRHPHIIKL		YQVISTPSDI
FMVMEYVSGG		ELFDYICKNG		RLDEKESRRL		FQQILSGVDY		CHRHMVVHRD
LKPENVLLDA		HMNAKIADFG		LSNMMSDGEF		LRTSCGSPNY		AAPEVISGRL
YAGPEVDIWS		SGVILYALLC		GTLPFDDDHV		PTLFKKICDG		IFYTPQYLNP
SVISLLKHML		QVDPMKRATI		KDIREHEWFK		QDLPKYLFPE		DPSYSSTMID
DEALKEVCEK		FECSEEEVLS		CLYNRNHQDP		LAVAYHLIID		NRRIMNEAKD
FYLATSPPDS		FLDDHHLTRP		HPERVPFLVA		ETPRARHTLD		ELNPQKSKHQ
GVRKAKWHLG		IRSQSRPNDI		MAEVCRAIKQ		LDYEWKVVNP		YYLRVRRKNP
VTSTYSKMSL		QLYQVDSRTY		LLDFRSIDDE		ITEAKSGTAT		PQRSGSVSNY
RSCQRSDSDA		EAQGKSSEVS		LTSSVTSLDS		SPVDLTPRPG		SHTIEFFEMC
ANLIKILAQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, біологічні ритми, автофагія, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів, біосинтез холестеролу, біосинтез стероїдів, біосинтез стеролів, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Crute B.E., Seefeld K., Gamble J., Kemp B.E., Witters L.A. (1998). Functional domains of the alpha1 catalytic subunit of the AMP-activated protein kinase. J. Biol. Chem. 273: 35347—35354. PMID 9857077 DOI:10.1074/jbc.273.52.35347
• Imamura K., Ogura T., Kishimoto A., Kaminishi M., Esumi H. (2001). Cell cycle regulation via p53 phosphorylation by a 5'-AMP activated protein kinase activator, 5-aminoimidazole-4-carboxamide-1-beta-D-ribofuranoside, in a human hepatocellular carcinoma cell line. Biochem. Biophys. Res. Commun. 287: 562—567. PMID 11554766 DOI:10.1006/bbrc.2001.5627
• Hallows K.R., Kobinger G.P., Wilson J.M., Witters L.A., Foskett J.K. (2003). Physiological modulation of CFTR activity by AMP-activated protein kinase in polarized T84 cells. Am. J. Physiol. 284: C1297—C1308. PMID 12519745 DOI:10.1152/ajpcell.00227.2002
• Inoki K., Zhu T., Guan K.L. (2003). TSC2 mediates cellular energy response to control cell growth and survival. Cell. 115: 577—590. PMID 14651849 DOI:10.1016/S0092-8674(03)00929-2
• Towler M.C., Hardie D.G. (2007). AMP-activated protein kinase in metabolic control and insulin signaling. Circ. Res. 100: 328—341. PMID 17307971 DOI:10.1161/01.RES.0000256090.42690.05

Див. також

• Хромосома 5