PPIH

PPIH (англ. Peptidylprolyl isomerase H) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 177 амінокислот, а молекулярна маса — 19 208.

PPIH
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MZW, 1QOI
Ідентифікатори
Символи	PPIH, CYP-20, CYPH, SnuCyp-20, USA-CYP, peptidylprolyl isomerase H
Зовнішні ІД	OMIM: 606095 MGI: 106499 HomoloGene: 38172 GeneCards: PPIH
Онтологія гена Молекулярна функція • ribonucleoprotein complex binding • isomerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • cyclosporin A binding • unfolded protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • U4/U6 snRNP Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • positive regulation of viral genome replication • згортання білків • Сплайсинг РНК • GO:0034622 protein-containing complex assembly • protein peptidyl-prolyl isomerization • Ангіогенез • protein refolding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10465	66101
Ensembl	ENSG00000171960	ENSMUSG00000060288
UniProt	O43447	Q9D868
RefSeq (мРНК)	NM_006347 NM_001330510	NM_001110129 NM_001110130 NM_028677
RefSeq (білок)	NP_001317439 NP_006338	NP_001103599 NP_001103600 NP_082953
Локус (UCSC)	Хр. 1: 42.66 – 42.68 Mb	Хр. 4: 119.16 – 119.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVANSSPVN		PVVFFDVSIG		GQEVGRMKIE		LFADVVPKTA		ENFRQFCTGE
FRKDGVPIGY		KGSTFHRVIK		DFMIQGGDFV		NGDGTGVASI		YRGPFADENF
KLRHSAPGLL		SMANSGPSTN		GCQFFITCSK		CDWLDGKHVV		FGKIIDGLLV
MRKIENVPTG		PNNKPKLPVV		ISQCGEM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, ізомераз, ротамаз. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Horowitz D.S., Lee E.J., Mabon S.A., Misteli T. (2002). A cyclophilin functions in pre-mRNA splicing. EMBO J. 21: 470—480. PMID 11823439 DOI:10.1093/emboj/21.3.470
• Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
• Horowitz D.S., Kobayashi R., Krainer A.R. (1997). A new cyclophilin and the human homologues of yeast Prp3 and Prp4 form a complex associated with U4/U6 snRNPs. RNA. 3: 1374—1387. PMID 9404889

Див. також

• Хромосома 1