POLR2C

POLR2C (англ. RNA polymerase II subunit C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 275 амінокислот, а молекулярна маса — 31 441.

POLR2C
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IYC, 5IY6, 5IYD, 5IY8, 5IY7, 5IY9, 5IYA, 5IYB,%%s5IYD, 5IY8, 5IYC, 5IY6, 5IY7, 5IYA, 5IY9, 5IYB
Ідентифікатори
Символи	POLR2C, RPB3, RPB31, hRPB33, hsRPB3, polymerase (RNA) II subunit C, RNA polymerase II subunit C
Зовнішні ІД	OMIM: 180663 MGI: 109299 HomoloGene: 2017 GeneCards: POLR2C
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein dimerization activity • RNA polymerase II activity • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • microtubule cytoskeleton • РНК-полімераза II • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • RNA metabolic process • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • positive regulation of viral transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5432	20021
Ensembl	ENSG00000102978	ENSMUSG00000031783
UniProt	P19387 Q6FGR6	P97760
RefSeq (мРНК)	NM_002694 NM_032940	NM_009090
RefSeq (білок)	NP_116558 NP_116558.1	NP_033116
Локус (UCSC)	Хр. 16: 57.46 – 57.47 Mb	Хр. 8: 95.58 – 95.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPYANQPTVR		ITELTDENVK		FIIENTDLAV		ANSIRRVFIA		EVPIIAIDWV
QIDANSSVLH		DEFIAHRLGL		IPLISDDIVD		KLQYSRDCTC		EEFCPECSVE
FTLDVRCNED		QTRHVTSRDL		ISNSPRVIPV		TSRNRDNDPN		DYVEQDDILI
VKLRKGQELR		LRAYAKKGFG		KEHAKWNPTA		GVAFEYDPDN		ALRHTVYPKP
EEWPKSEYSE		LDEDESQAPY		DPNGKPERFY		YNVESCGSLR		PETIVLSALS
GLKKKLSDLQ		TQLSHEIQSD		VLTIN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як транскрипція. Локалізований у ядрі.

Література

• Dammann R., Pfeifer G.P. (1998). Cloning and characterization of the human RNA polymerase I subunit hRPA40. Biochim. Biophys. Acta. 1396: 153—157. PMID 9540830 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00206-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
• Pati U.K., Weissman S.M. (1990). The amino acid sequence of the human RNA polymerase II 33-kDa subunit hRPB 33 is highly conserved among eukaryotes. J. Biol. Chem. 265: 8400—8403. PMID 2187864

Див. також

• Хромосома 16