POLR1E

POLR1E (англ. RNA polymerase I subunit E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 481 амінокислот, а молекулярна маса — 53 962.

POLR1E
Ідентифікатори
Символи	POLR1E, PAF53, PRAF1, polymerase (RNA) I subunit E, RNA polymerase I subunit E, A49, RPA49
Зовнішні ІД	MGI: 1929022 HomoloGene: 41486 GeneCards: POLR1E
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • DNA binding • RNA polymerase I general transcription initiation factor binding • RNA polymerase I activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • fibrillar center • ядерце • RNA polymerase I complex Біологічний процес • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • transcription, DNA-templated • RNA polymerase I preinitiation complex assembly • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64425	64424
Ensembl	ENSG00000137054	ENSMUSG00000028318
UniProt	Q9GZS1	Q8K202
RefSeq (мРНК)	NM_001282766 NM_022490	NM_001285800 NM_022811
RefSeq (білок)	NP_001269695 NP_071935	NP_001272729 NP_073722
Локус (UCSC)	Хр. 9: 37.49 – 37.5 Mb	Хр. 4: 45.02 – 45.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYQASAVSLL		PRDIPSCHSP		SPGFSHLPTS		SSQLAPDLLQ		FPLGQDPSFL
AIPILTLPPS		DSLVPPYIVW		YIVWPSALIS		FLGCTLTVQF		SNGKLQSPGN
MRFTLYENKD		STNPRKRNQR		ILAAETDRLS		YVGNNFGTGA		LKCNTLCRHF
VGILNKTSGQ		MEVYDAELFN		MQPLFSDVSV		ESELALESQT		KTYREKMDSC
IEAFGTTKQK		RALNTRRMNR		VGNESLNRAV		AKAAETIIDT		KGVTALVSDA
IHNDLQDDSL		YLPPCYDDAA		KPEDVYKFED		LLSPAEYEAL		QSPSEAFRNV
TSEEILKMIE		ENSHCTFVIE		ALKSLPSDVE		SRDRQARCIW		FLDTLIKFRA
HRVVKRKSAL		GPGVPHIINT		KLLKHFTCLT		YNNGRLRNLI		SDSMKAKITA
YVIILALHIH		DFQIDLTVLQ		RDLKLSEKRM		MEIAKAMRLK		ISKRRVSVAA
GSEEDHKLGT		LSLPLPPAQT		SDRLAKRRKI		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9