PLEKHF1

PLEKHF1 (англ. Pleckstrin homology and FYVE domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 279 амінокислот, а молекулярна маса — 31 195.

PLEKHF1
Ідентифікатори
Символи	PLEKHF1, APPD, LAPF, PHAFIN1, ZFYVE15, pleckstrin homology and FYVE domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615200 MGI: 1919537 HomoloGene: 11516 GeneCards: PLEKHF1
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol-4-phosphate binding • phosphatidylinositol-5-phosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • зв'язування з іоном металу • phosphatidylinositol binding Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • lysosomal membrane • ендосома • лізосома • endosome membrane • клітинне ядро Біологічний процес • protein localization to plasma membrane • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of autophagy • endosome organization • vesicle organization • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79156	72287
Ensembl	ENSG00000166289	ENSMUSG00000074170
UniProt	Q96S99	Q3TB82
RefSeq (мРНК)	NM_024310	NM_024413
RefSeq (білок)	NP_077286	NP_077724
Локус (UCSC)	Хр. 19: 29.67 – 29.68 Mb	Хр. 7: 37.92 – 37.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVDHLANTEI		NSQRIAAVES		CFGASGQPLA		LPGRVLLGEG		VLTKECRKKA
KPRIFFLFND		ILVYGSIVLN		KRKYRSQHII		PLEEVTLELL		PETLQAKNRW
MIKTAKKSFV		VSAASATERQ		EWISHIEECV		RRQLRATGRP		PSTEHAAPWI
PDKATDICMR		CTQTRFSALT		RRHHCRKCGF		VVCAECSRQR		FLLPRLSPKP
VRVCSLCYRE		LAAQQRQEEA		EEQGAGSPGQ		PAHLARPICG		ASSGDDDDSD
EDKEGSRDGD		WPSSVEFYAS		GVAWSAFHS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як апоптоз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, лізосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19