PITRM1

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

PITRM1 (англ. Pitrilysin metallopeptidase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 037 амінокислот, а молекулярна маса — 117 413[5].

PITRM1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PITRM1, MP1, PreP, pitrilysin metallopeptidase 1, SCAR30
Зовнішні ІД OMIM: 618211 MGI: 1916867 HomoloGene: 5742 GeneCards: PITRM1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_145131
NM_001360106
RefSeq (білок)
NP_660113
NP_001347035
Локус (UCSC) Хр. 10: 3.14 – 3.17 Mb Хр. 13: 6.6 – 6.63 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MWRCGGRQGLCVLRRLSGGHAHHRAWRWNSNRACERALQYKLGDKIHGFT
VNQVTSVPELFLTAVKLTHDDTGARYLHLAREDTNNLFSVQFRTTPMDST
GVPHILEHTVLCGSQKYPCRDPFFKMLNRSLSTFMNAFTASDYTLYPFST
QNPKDFQNLLSVYLDATFFPCLRELDFWQEGWRLEHENPSDPQTPLVFKG
VVFNEMKGAFTDNERIFSQHLQNRLLPDHTYSVVSGGDPLCIPELTWEQL
KQFHATHYHPSNARFFTYGNFPLEQHLKQIHEEALSKFQKIEPSTVVPAQ
TPWDKPREFQITCGPDSFATDPSKQTTISVSFLLPDITDTFEAFTLSLLS
SLLTSGPNSPFYKALIESGLGTDFSPDVGYNGYTREAYFSVGLQGIAEKD
IETVRSLIDRTIDEVVEKGFEDDRIEALLHKIEIQMKHQSTSFGLMLTSY
IASCWNHDGDPVELLKLGNQLAKFRQCLQENPKFLQEKVKQYFKNNQHKL
TLSMRPDDKYHEKQAQVEATKLKQKVEALSPGDRQQIYEKGLELRSQQSK
PQDASCLPALKVSDIEPTIPVTELDVVLTAGDIPVQYCAQPTNGMVYFRA
FSSLNTLPEELRPYVPLFCSVLTKLGCGLLDYREQAQQIELKTGGMSASP
HVLPDDSHMDTYEQGVLFSSLCLDRNLPDMMQLWSEIFNNPCFEEEEHFK
VLVKMTAQELANGIPDSGHLYASIRAGRTLTPAGDLQETFSGMDQVRLMK
RIAEMTDIKPILRKLPRIKKHLLNGDNMRCSVNATPQQMPQTEKAVEDFL
RSIGRSKKERRPVRPHTVEKPVPSSSGGDAHVPHGSQVIRKLVMEPTFKP
WQMKTHFLMPFPVNYVGECIRTVPYTDPDHASLKILARLMTAKFLHTEIR
EKGGAYGGGAKLSHNGIFTLYSYRDPNTIETLQSFGKAVDWAKSGKFTQQ
DIDEAKLSVFSTVDAPVAPSDKGMDHFLYGLSDEMKQAHREQLFAVSHDK
LLAVSDRYLGTGKSTHGLAILGPENPKIAKDPSWIIQ

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мітохондрії.

Література

ред.
  • Mzhavia N., Berman Y.L., Qian Y., Yan L., Devi L.A. (1999). Cloning, expression, and characterization of human metalloprotease 1: a novel member of the pitrilysin family of metalloendoproteases. DNA Cell Biol. 18: 369—380. PMID 10360838 DOI:10.1089/104454999315268
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

ред.

Див. також

ред.