PIR

PIR (англ. Pirin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 290 амінокислот, а молекулярна маса — 32 113.

PIR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4ERO, 4EWD, 4GUL, 1J1L, 4EWA, 4HLT, 3ACL, 4EWE
Ідентифікатори
Символи	PIR, pirin
Зовнішні ІД	OMIM: 300931 MGI: 1916906 HomoloGene: 2717 GeneCards: PIR
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • quercetin 2,3-dioxygenase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • myeloid cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • monocyte differentiation • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • травлення • regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8544	69656
Ensembl	ENSG00000087842	ENSMUSG00000031379
UniProt	O00625	Q9D711
RefSeq (мРНК)	NM_003662 NM_001018109	NM_001301402 NM_027153
RefSeq (білок)	NP_001018119 NP_003653	NP_001288331 NP_081429
Локус (UCSC)	Хр. X: 15.38 – 15.49 Mb	Хр. X: 163.05 – 163.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSSKKVTLS		VLSREQSEGV		GARVRRSIGR		PELKNLDPFL		LFDEFKGGRP
GGFPDHPHRG		FETVSYLLEG		GSMAHEDFCG		HTGKMNPGDL		QWMTAGRGIL
HAEMPCSEEP		AHGLQLWVNL		RSSEKMVEPQ		YQELKSEEIP		KPSKDGVTVA
VISGEALGIK		SKVYTRTPTL		YLDFKLDPGA		KHSQPIPKGW		TSFIYTISGD
VYIGPDDAQQ		KIEPHHTAVL		GEGDSVQVEN		KDPKRSHFVL		IAGEPLREPV
IQHGPFVMNT		NEEISQAILD		FRNAKNGFER		AKTWKSKIGN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Wendler W.M.F., Kremmer E., Foerster R., Winnacker E.-L. (1997). Identification of pirin, a novel highly conserved nuclear protein. J. Biol. Chem. 272: 8482—8489. PMID 9079676 DOI:10.1074/jbc.272.13.8482
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Adams M., Jia Z. (2005). Structural and biochemical analysis reveal pirins to possess quercetinase activity. J. Biol. Chem. 280: 28675—28682. PMID 15951572 DOI:10.1074/jbc.M501034200
• Gelbman B.D., Heguy A., O'Connor T.P., Zabner J., Crystal R.G. (2007). Upregulation of pirin expression by chronic cigarette smoking is associated with bronchial epithelial cell apoptosis. Respir. Res. 8: 10—10. PMID 17288615 DOI:10.1186/1465-9921-8-10
• Licciulli S., Cambiaghi V., Scafetta G., Gruszka A.M., Alcalay M. (2010). Pirin downregulation is a feature of AML and leads to impairment of terminal myeloid differentiation. Leukemia. 24: 429—437. PMID 20010624 DOI:10.1038/leu.2009.247
• Miyazaki I., Simizu S., Okumura H., Takagi S., Osada H. (2010). A small-molecule inhibitor shows that pirin regulates migration of melanoma cells. Nat. Chem. Biol. 6: 667—673. PMID 20711196 DOI:10.1038/nchembio.423

Див. також

• Хромосома X