PHYHD1

PHYHD1 (англ. Phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 32 411.

PHYHD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2OPW, 3OBZ
Ідентифікатори
Символи	PHYHD1, phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1
Зовнішні ІД	MGI: 3612860 HomoloGene: 14939 GeneCards: PHYHD1
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	254295	227696
Ensembl	ENSG00000175287	ENSMUSG00000079484
UniProt	Q5SRE7	Q9DB26
RefSeq (мРНК)	NM_174933 NM_001100876 NM_001100877	NM_001252568 NM_001252570 NM_001252571 NM_001281829 NM_172267
RefSeq (білок)	NP_001094346 NP_001094347 NP_777593 NP_777593.2	NP_001239497 NP_001239499 NP_001239500 NP_001268758 NP_758471
Локус (UCSC)	Хр. 9: 128.92 – 128.94 Mb	Хр. 2: 30.16 – 30.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MACLSPSQLQ		KFQQDGFLVL		EGFLSAEECV		AMQQRIGEIV		AEMDVPLHCR
TEFSTQEEEQ		LRAQGSTDYF		LSSGDKIRFF		FEKGVFDEKG		NFLVPPEKSI
NKIGHALHAH		DPVFKSITHS		FKVQTLARSL		GLQMPVVVQS		MYIFKQPHFG
GEVSPHQDAS		FLYTEPLGRV		LGVWIAVEDA		TLENGCLWFI		PGSHTSGVSR
RMVRAPVGSA		PGTSFLGSEP		ARDNSLFVPT		PVQRGALVLI		HGEVVHKSKQ
NLSDRSRQAY		TFHLMEASGT		TWSPENWLQP		TAELPFPQLY		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9