PHF2

PHF2 (англ. PHD finger protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 096 амінокислот, а молекулярна маса — 120 775.

PHF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3KQI, 3PTR, 3PU3, 3PU8, 3PUA, 3PUS
Ідентифікатори
Символи	PHF2, CENP-35, GRC5, JHDM1E, PHD finger protein 2, KDM7C
Зовнішні ІД	OMIM: 604351 MGI: 1338034 HomoloGene: 3934 GeneCards: PHF2
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidoreductase activity • histone demethylase activity • zinc ion binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • хромосома • ядерце • центромера • кінетохор • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K9 demethylation • protein demethylation • transcription, DNA-templated • negative regulation of ribosomal DNA heterochromatin assembly • liver development • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5253	18676
Ensembl	ENSG00000197724	ENSMUSG00000038025
UniProt	O75151	Q9WTU0
RefSeq (мРНК)	NM_005392 NM_024517	NM_011078
RefSeq (білок)	NP_005383	NP_035208
Локус (UCSC)	Хр. 9: 93.58 – 93.68 Mb	Хр. 13: 48.96 – 49.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATVPVYCVC		RLPYDVTRFM		IECDACKDWF		HGSCVGVEEE		EAPDIDIYHC
PNCEKTHGKS		TLKKKRTWHK		HGPGQAPDVK		PVQNGSQLFI		KELRSRTFPS
AEDVVARVPG		SQLTLGYMEE		HGFTEPILVP		KKDGLGLAVP		APTFYVSDVE
NYVGPERSVD		VTDVTKQKDC		KMKLKEFVDY		YYSTNRKRVL		NVTNLEFSDT
RMSSFVEPPD		IVKKLSWVEN		YWPDDALLAK		PKVTKYCLIC		VKDSYTDFHI
DSGGASAWYH		VLKGEKTFYL		IRPASANISL		YERWRSASNH		SEMFFADQVD
KCYKCIVKQG		QTLFIPSGWI		YATLTPVDCL		AFAGHFLHSL		SVEMQMRAYE
VERRLKLGSL		TQFPNFETAC		WYMGKHLLEA		FKGSHKSGKQ		LPPHLVQGAK
ILNGAFRSWT		KKQALAEHED		ELPEHFKPSQ		LIKDLAKEIR		LSENASKAVR
PEVNTVASSD		EVCDGDREKE		EPPSPIEATP		PQSLLEKVSK		KKTPKTVKMP
KPSKIPKPPK		PPKPPRPPKT		LKLKDGGKKK		GKKSRESASP		TIPNLDLLEA
HTKEALTKME		PPKKGKATKS		VLSVPNKDVV		HMQNDVERLE		IREQTKSKSE
AKWKYKNSKP		DSLLKMEEEQ		KLEKSPLAGN		KDNKFSFSFS		NKKLLGSKAL
RPPTSPGVFG		ALQNFKEDKP		KPVRDEYEYV		SDDGELKIDE		FPIRRKKNAP
KRDLSFLLDK		KAVLPTPVTK		PKLDSAAYKS		DDSSDEGSLH		IDTDTKPGRN
ARVKKESGSS		AAGILDLLQA		SEEVGALEYN		PSSQPPASPS		TQEAIQGMLS
MANLQASDSC		LQTTWGAGQA		KGSSLAAHGA		RKNGGGSGKS		AGKRLLKRAA
KNSVDLDDYE		EEQDHLDACF		KDSDYVYPSL		ESDEDNPIFK		SRSKKRKGSD
DAPYSPTARV		GPSVPRQDRP		VREGTRVASI		ETGLAAAAAK		LSQQEEQKSK
KKKSAKRKLT		PNTTSPSTST		SISAGTTSTS		TTPASTTPAS		TTPASTSTAS
SQASQEGSSP		EPPPESHSSS		LADHEYTAAG		TFTGAQAGRT		SQPMAPGVFL
TQRRPSASSP		NNNTAAKGKR		TKKGMATAKQ		RLGKILKIHR		NGKLLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

• Horton J.R., Upadhyay A.K., Hashimoto H., Zhang X., Cheng X. (2011). Structural basis for human PHF2 Jumonji domain interaction with metal ions. J. Mol. Biol. 406: 1—8. PMID 21167174 DOI:10.1016/j.jmb.2010.12.013

Див. також

• Хромосома 9