PGLYRP3

PGLYRP3 (англ. Peptidoglycan recognition protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот, а молекулярна маса — 37 611.

PGLYRP3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1SK3, 1SK4, 1TWQ, 2APH
Ідентифікатори
Символи	PGLYRP3, PGRP-Ialpha, PGRPIA, PGLYRPIalpha, peptidoglycan recognition protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 608197 MGI: 2685266 HomoloGene: 71559 GeneCards: PGLYRP3
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity • peptidoglycan immune receptor activity • peptidoglycan binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • мембрана • extracellular region • GO:0009327 protein-containing complex • міжклітинний простір Біологічний процес • процес імунної системи • negative regulation of natural killer cell differentiation involved in immune response • negative regulation of interferon-gamma production • вроджений імунітет • defense response to bacterium • detection of bacterium • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • peptidoglycan catabolic process • pattern recognition receptor signaling pathway • antimicrobial humoral response • positive regulation of cytolysis in other organism • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • killing of cells of other organism Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	114771	242100
Ensembl	ENSG00000159527	ENSMUSG00000042244
UniProt	Q96LB9	A1A547
RefSeq (мРНК)	NM_052891	NM_207247
RefSeq (білок)	NP_443123	NP_997130
Локус (UCSC)	Хр. 1: 153.3 – 153.31 Mb	Хр. 3: 91.92 – 91.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGTLPWLLAF		FILGLQAWDT		PTIVSRKEWG		ARPLACRALL		TLPVAYIITD
QLPGMQCQQQ		SVCSQMLRGL		QSHSVYTIGW		CDVAYNFLVG		DDGRVYEGVG
WNIQGLHTQG		YNNISLGIAF		FGNKIGSSPS		PAALSAAEGL		ISYAIQKGHL
SPRYIQPLLL		KEETCLDPQH		PVMPRKVCPN		IIKRSAWEAR		ETHCPKMNLP
AKYVIIIHTA		GTSCTVSTDC		QTVVRNIQSF		HMDTRNFCDI		GYHFLVGQDG
GVYEGVGWHI		QGSHTYGFND		IALGIAFIGY		FVEKPPNAAA		LEAAQDLIQC
AVVEGYLTPN		YLLMGHSDVV		NILSPGQALY		NIISTWPHFK		H

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет. Секретований назовні.

Література

• Liu C., Xu Z., Gupta D., Dziarski R. (2001). Peptidoglycan recognition proteins: a novel family of four human innate immunity pattern recognition molecules. J. Biol. Chem. 276: 34686—34694. PMID 11461926 DOI:10.1074/jbc.M105566200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Guan R., Malchiodi E.L., Wang Q., Schuck P., Mariuzza R.A. (2004). Crystal structure of the C-terminal peptidoglycan-binding domain of human peptidoglycan recognition protein Ialpha. J. Biol. Chem. 279: 31873—31882. PMID 15140887 DOI:10.1074/jbc.M404920200

Див. також

• Хромосома 1