PGBD1

PGBD1 (англ. PiggyBac transposable element derived 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 809 амінокислот, а молекулярна маса — 92 515.

PGBD1
Ідентифікатори
Символи	PGBD1, HUCEP-4, SCAND4, dJ874C20.4, piggyBac transposable element derived 1
Зовнішні ІД	MGI: 2441675 HomoloGene: 130030 GeneCards: PGBD1
Онтологія гена Молекулярна функція • scavenger receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • мембрана Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • рецептор-опосередкований ендоцитоз • vesicle-mediated transport • ендоцитоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84547	319207
Ensembl	ENSG00000137338	ENSMUSG00000055313
UniProt	Q96JS3	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001184743 NM_032507	NM_001012311 NM_001162919 NM_001162920
RefSeq (білок)	NP_001171672 NP_115896	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 28.28 – 28.3 Mb	Хр. 13: 21.61 – 21.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYEALPGPAP		ENEDGLVKVK		EEDPTWEQVC		NSQEGSSHTQ		EICRLRFRHF
CYQEAHGPQE		ALAQLRELCH		QWLRPEMHTK		EQIMELLVLE		QFLTILPKEL
QPCVKTYPLE		SGEEAVTVLE		NLETGSGDTG		QQASVYIQGQ		DMHPMVAEYQ
GVSLECQSLQ		LLPGITTLKC		EPPQRPQGNP		QEVSGPVPHG		SAHLQEKNPR
DKAVVPVFNP		VRSQTLVKTE		EETAQAVAAE		KWSHLSLTRR		NLCGNSAQET
VMSLSPMTEE		IVTKDRLFKA		KQETSEEMEQ		SGEASGKPNR		ECAPQIPCST
PIATERTVAH		LNTLKDRHPG		DLWARMHISS		LEYAAGDITR		KGRKKDKARV
SELLQGLSFS		GDSDVEKDNE		PEIQPAQKKL		KVSCFPEKSW		TKRDIKPNFP
SWSALDSGLL		NLKSEKLNPV		ELFELFFDDE		TFNLIVNETN		NYASQKNVSL
EVTVQEMRCV		FGVLLLSGFM		RHPRREMYWE		VSDTDQNLVR		DAIRRDRFEL
IFSNLHFADN		GHLDQKDKFT		KLRPLIKQMN		KNFLLYAPLE		EYYCFDKSMC
ECFDSDQFLN		GKPIRIGYKI		WCGTTTQGYL		VWFEPYQEES		TMKVDEDPDL
GLGGNLVMNF		ADVLLERGQY		PYHLCFDSFF		TSVKLLSALK		KKGVRATGTI
RENRTEKCPL		MNVEHMKKMK		RGYFDFRIEE		NNEIILCRWY		GDGIISLCSN
AVGIEPVNEV		SCCDADNEEI		PQISQPSIVK		VYDECKEGVA		KMDQIISKYR
VRIRSKKWYS		ILVSYMIDVA		MNNAWQLHRA		CNPGASLDPL		DFRRFVAHFY
LEHNAHLSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6