PGAP1

PGAP1 (англ. Post-GPI attachment to proteins 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 922 амінокислот, а молекулярна маса — 105 383.

PGAP1
Ідентифікатори
Символи	PGAP1, Bst1, ISPD3024, MRT42, SPG67, post-GPI attachment to proteins 1, post-GPI attachment to proteins inositol deacylase 1, NEDDSBA
Зовнішні ІД	OMIM: 611655 MGI: 2443342 HomoloGene: 41605 GeneCards: PGAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • phosphoric ester hydrolase activity • hydrolase activity • hydrolase activity, acting on ester bonds • phosphatidylinositol deacylase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • embryonic pattern specification • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • head development • attachment of GPI anchor to protein • слух • forebrain regionalization • protein transport • GPI anchor biosynthetic process • myo-inositol transport • anterior/posterior axis specification • GPI anchor metabolic process • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80055	241062
Ensembl	ENSG00000197121	ENSMUSG00000073678
UniProt	Q75T13	Q3UUQ7
RefSeq (мРНК)	NM_024989 NM_001321099 NM_001321100	NM_001163314 NM_175508
RefSeq (білок)	NP_001308028 NP_001308029 NP_079265	NP_001156786
Локус (UCSC)	Хр. 2: 196.83 – 196.93 Mb	Хр. 1: 54.51 – 54.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFLHSVNLWN		LAFYVFMVFL		ATLGLWDVFF		GFEENKCSMS		YMFEYPEYQK
IELPKKLAKR		YPAYELYLYG		EGSYAEEHKI		LPLTGIPVLF		LPGNAGSYKQ
VRSIGSIALR		KAEDIDFKYH		FDFFSVNFNE		ELVALYGGSL		QKQTKFVHEC
IKTILKLYKG		QEFAPKSVAI		IGHSMGGLVA		RALLTLKNFK		HDLINLLITQ
ATPHVAPVMP		LDRFITDFYT		TVNNYWILNA		RHINLTTLSV		AGGFRDYQVR
SGLTFLPKLS		HHTSALSVVS		SAVPKTWVST		DHLSIVWCKQ		LQLTTVRAFF
DLIDADTKQI		TQNSKKKLSV		LYHHFIRHPS		KHFEENPAII		SDLTGTSMWV
LVKVSKWTYV		AYNESEKIYF		TFPLENHRKI		YTHVYCQSTM		LDTNSWIFAC
INSTSMCLQG		VDLSWKAELL		PTIKYLTLRL		QDYPSLSHLV		VYVPSVRGSK
FVVDCEFFKK		EKRYIQLPVT		HLFSFGLSSR		KVVLNTNGLY		YNLELLNFGQ
IYQAFKINVV		SKCSAVKEEI		TSIYRLHIPW		SYEDSLTIAQ		APSSTEISLK
LHIAQPENNT		HVALFKMYTS		SDCRYEVTVK		TSFSQILGQV		VRFHGGALPA
YVVSNILLAY		RGQLYSLFST		GCCLEYATML		DKEAKPYKVD		PFVIIIKFLL
GYKWFKELWD		VLLLPELDAV		ILTCQSMCFP		LISLILFLFG		TCTAYWSGLL
SSASVRLLSS		LWLALKRPSE		LPKDIKMISP		DLPFLTIVLI		IVSWTTCGAL
AILLSYLYYV		FKVVHLQASL		TTFKNSQPVN		PKHSRRSEKK		SNHHKDSSIH
HLRLSANDAE		DSLRMHSTVI		NLLTWIVLLS		MPSLIYWLKN		LRYYFKLNPD
PCKPLAFILI		PTMAILGNTY		TVSIKSSKLL		KTTSQFPLPL		AVGVIAFGSA
HLYRLPCFVF		IPLLLHALCN		FM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Tanaka S., Maeda Y., Tashima Y., Kinoshita T. (2004). Inositol deacylation of glycosylphosphatidylinositol-anchored proteins is mediated by mammalian PGAP1 and yeast Bst1p. J. Biol. Chem. 279: 14256—14263. PMID 14734546 DOI:10.1074/jbc.M313755200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2