PEF1

PEF1 (англ. Penta-EF-hand domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 284 амінокислот, а молекулярна маса — 30 381.

PEF1
Ідентифікатори
Символи	PEF1, ABP32, PEF1A, penta-EF-hand domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610033 MGI: 1915148 HomoloGene: 56569 GeneCards: PEF1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein dimerization activity • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity • protein heterodimerization activity • RNA binding • calcium-dependent protein binding • GO:0032947 molecular adaptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • екзосома • мембрана • Golgi membrane • COPII vesicle coat • Cul3-RING ubiquitin ligase complex • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • response to calcium ion • протеоліз • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • neural crest formation • neural crest cell development • COPII vesicle coating • positive regulation of protein monoubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	553115	67898
Ensembl	ENSG00000162517	ENSMUSG00000028779
UniProt	Q9UBV8	Q8BFY6
RefSeq (мРНК)	NM_012392 NM_001359651	NM_026441
RefSeq (білок)	NP_036524 NP_001346580	NP_080717
Локус (UCSC)	Хр. 1: 31.63 – 31.64 Mb	Хр. 4: 130 – 130.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASYPYRQGC		PGAAGQAPGA		PPGSYYPGPP		NSGGQYGSGL		PPGGGYGGPA
PGGPYGPPAG		GGPYGHPNPG		MFPSGTPGGP		YGGAAPGGPY		GQPPPSSYGA
QQPGLYGQGG		APPNVDPEAY		SWFQSVDSDH		SGYISMKELK		QALVNCNWSS
FNDETCLMMI		NMFDKTKSGR		IDVYGFSALW		KFIQQWKNLF		QQYDRDRSGS
ISYTELQQAL		SQMGYNLSPQ		FTQLLVSRYC		PRSANPAMQL		DRFIQVCTQL
QVLTEAFREK		DTAVQGNIRL		SFEDFVTMTA		SRML

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kitaura Y., Matsumoto S., Satoh H., Hitomi K., Maki M. (2001). Peflin and ALG-2, members of the penta-EF-hand protein family, form a heterodimer that dissociates in a Ca2+-dependent manner. J. Biol. Chem. 276: 14053—14058. PMID 11278427 DOI:10.1074/jbc.M008649200
• Kitaura Y., Satoh H., Takahashi H., Shibata H., Maki M. (2002). Both ALG-2 and peflin, penta-EF-hand (PEF) proteins, are stabilized by dimerization through their fifth EF-hand regions. Arch. Biochem. Biophys. 399: 12—18. PMID 11883899 DOI:10.1006/abbi.2001.2736

Див. також

• Хромосома 1