PDZD4
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
PDZD4 (англ. PDZ domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 769 амінокислот, а молекулярна маса — 86 171[4].
PDZD4 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PDZD4, LU1, PDZK4, PDZRN4L, PDZ domain containing 4, LNX5 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 300634 MGI: 2443483 HomoloGene: 13046 GeneCards: PDZD4 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. X: 153.8 – 153.83 Mb | Хр. X: 72.84 – 72.87 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGCNMCVVQK | PEEQYKVMLQ | VNGKELSKLS | QEQTLQALRS | SKEPLVIQVL | ||||
RRSPRLRGDS | SCHDLQLVDS | GTQTDITFEH | IMALGKLRPP | TPPMVILEPP | ||||
PISHEYYDPA | EFMEGGPQEA | DRLDELEYEE | VELYKSSHRD | KLGLMVCYRT | ||||
DDEEDLGIYV | GEVNPNSIAA | KDGRIREGDR | IIQINGVDVQ | NREEAVAILS | ||||
QEENTNISLL | VARPESQLAK | RWKDSDRDDF | LDDFGSENEG | ELRARKLKSP | ||||
PAQQPGNEEE | KGAPDAGPGL | SNSQELDSGV | GRTDESTRNE | ESSEHDLLGD | ||||
EPPSSTNTPG | SLRKFGLQGD | ALQSRDFHFS | MDSLLAEGAG | LGGGDVPGLT | ||||
DEEYERYREL | LEIKCHLENG | NQLGLLFPRA | SGGNSALDVN | RNESLGHEMA | ||||
MLEEELRHLE | FKCRNILRAQ | KMQQLRERCM | KAWLLEEESL | YDLAASEPKK | ||||
HELSDISELP | EKSDKDSTSA | YNTGESCRST | PLLVEPLPES | PLRRAMAGNS | ||||
NLNRTPPGPA | VATPAKAAPP | PGSPAKFRSL | SRDPEAGRRQ | HAEERGRRNP | ||||
KTGLTLERVG | PESSPYLSRR | HRGQGQEGEH | YHSCVQLAPT | RGLEELGHGP | ||||
LSLAGGPRVG | GVAAAATEAP | RMEWKVKVRS | DGTRYVAKRP | VRDRLLKARA | ||||
LKIREERSGM | TTDDDAVSEM | KMGRYWSKEE | RKQHLIRARE | QRKRREFMMQ | ||||
SRLECLREQQ | NGDSKPELNI | IALSHRKTMK | KRNKKILDNW | ITIQEMLAHG | ||||
ARSADGKRVY | NPLLSVTTV |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.
Література
ред.- Nagayama S., Iiizumi M., Katagiri T., Toguchida J., Nakamura Y. (2004). Identification of PDZK4, a novel human gene with PDZ domains, that is upregulated in synovial sarcomas. Oncogene. 23: 5551—5557. PMID 15077175 DOI:10.1038/sj.onc.1207710
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human PDZRN4L gene and mouse Pdzrn4l gene in silico. Int. J. Mol. Med. 13: 923—927. PMID 15138636
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21167 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q76G19 (англ.) . Архів оригіналу за 12 квітня 2018. Процитовано 13 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |