PDXDC1

PDXDC1 (англ. Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 788 амінокислот, а молекулярна маса — 86 707.

PDXDC1
Ідентифікатори
Символи	PDXDC1, LP8165, pyridoxal-dependent decarboxylase domain containing 1, pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 614244 MGI: 1920909 HomoloGene: 22858 GeneCards: PDXDC1
Онтологія гена Молекулярна функція • pyridoxal phosphate binding • каталітична активність • carboxy-lyase activity • lyase activity • cadherin binding • sphinganine-1-phosphate aldolase activity Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • carboxylic acid metabolic process • ameboidal-type cell migration • sphingolipid metabolic process • sphingolipid catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23042	94184
Ensembl	ENSG00000275498 ENSG00000179889	ENSMUSG00000022680
UniProt	Q6P996	Q99K01
RefSeq (мРНК)	NM_001285444 NM_001285445 NM_001285447 NM_001285448 NM_001285449 NM_001285450 NM_015027 NM_001324019 NM_001324020 NM_001324021	NM_001039533 NM_001291017 NM_053181 NM_178853 NM_001357225
RefSeq (білок)	NP_001272373 NP_001272374 NP_001272376 NP_001272377 NP_001272378 NP_001272379 NP_001310948 NP_001310949 NP_001310950 NP_055842	NP_001034622 NP_001277946 NP_444411 NP_001344154
Локус (UCSC)	Хр. 16: 14.97 – 15.14 Mb	Хр. 16: 13.65 – 13.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDASLEKIAD		PTLAEMGKNL		KEAVKMLEDS		QRRTEEENGK		KLISGDIPGP
LQGSGQDMVS		ILQLVQNLMH		GDEDEEPQSP		RIQNIGEQGH		MALLGHSLGA
YISTLDKEKL		RKLTTRILSD		TTLWLCRIFR		YENGCAYFHE		EEREGLAKIC
RLAIHSRYED		FVVDGFNVLY		NKKPVIYLSA		AARPGLGQYL		CNQLGLPFPC
LCRVPCNTVF		GSQHQMDVAF		LEKLIKDDIE		RGRLPLLLVA		NAGTAAVGHT
DKIGRLKELC		EQYGIWLHVE		GVNLATLALG		YVSSSVLAAA		KCDSMTMTPG
PWLGLPAVPA		VTLYKHDDPA		LTLVAGLTSN		KPTDKLRALP		LWLSLQYLGL
DGFVERIKHA		CQLSQRLQES		LKKVNYIKIL		VEDELSSPVV		VFRFFQELPG
SDPVFKAVPV		PNMTPSGVGR		ERHSCDALNR		WLGEQLKQLV		PASGLTVMDL
EAEGTCLRFS		PLMTAAVLGT		RGEDVDQLVA		CIESKLPVLC		CTLQLREEFK
QEVEATAGLL		YVDDPNWSGI		GVVRYEHAND		DKSSLKSDPE		GENIHAGLLK
KLNELESDLT		FKIGPEYKSM		KSCLYVGMAS		DNVDAAELVE		TIAATAREIE
ENSRLLENMT		EVVRKGIQEA		QVELQKASEE		RLLEEGVLRQ		IPVVGSVLNW
FSPVQALQKG		RTFNLTAGSL		ESTEPIYVYK		AQGAGVTLPP		TPSGSRTKQR
LPGQKPFKRS		LRGSDALSET		SSVSHIEDLE		KVERLSSGPE		QITLEASSTE
GHPGAPSPQH		TDQTEAFQKG		VPHPEDDHSQ		VEGPESLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 16