PDSS1

PDSS1
Ідентифікатори
Символи	PDSS1, COQ1, COQ10D2, DPS, SPS, TPRT, TPT, TPT 1, hDPS1, prenyl (decaprenyl) diphosphate synthase, subunit 1, decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, COQ1A
Зовнішні ІД	OMIM: 607429 MGI: 1889278 HomoloGene: 5353 GeneCards: PDSS1
Пов'язані генетичні захворювання
	primary coenzyme Q10 deficiency 2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • protein heterodimerization activity; • GO:0036422 trans-hexaprenyltranstransferase activity; • transferase activity;
Клітинна компонента	• мітохондріальний матрикс; • мітохондрія; • transferase complex;
Біологічний процес	• isoprenoid biosynthetic process; • protein heterotetramerization; • ubiquinone biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23590
	56075
	ENSG00000148459
	ENSMUSG00000026784
	Q5T2R2
	Q33DR2
	NM_014317; NM_001321978; NM_001321979
	NM_019501; NM_001355467
	NP_001308907; NP_001308908; NP_055132
	NP_062374; NP_001342396
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDSS1 (англ. Decaprenyl diphosphate synthase subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 415 амінокислот, а молекулярна маса — 46 261^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASRWWRWRR	GCSWKPAARS	PGPGSPGRAG	PLGPSAAAEV	RAQVHRRKGL
DLSQIPYINL	VKHLTSACPN	VCRISRFHHT	TPDSKTHSGE	KYTDPFKLGW
RDLKGLYEDI	RKELLISTSE	LKEMSEYYFD	GKGKAFRPII	VALMARACNI
HHNNSRHVQA	SQRAIALIAE	MIHTASLVHD	DVIDDASSRR	GKHTVNKIWG
EKKAVLAGDL	ILSAASIALA	RIGNTTVISI	LTQVIEDLVR	GEFLQLGSKE
NENERFAHYL	EKTFKKTASL	IANSCKAVSV	LGCPDPVVHE	IAYQYGKNVG
IAFQLIDDVL	DFTSCSDQMG	KPTSADLKLG	LATGPVLFAC	QQFPEMNAMI
MRRFSLPGDV	DRARQYVLQS	DGVQQTTYLA	QQYCHEAIRE	ISKLRPSPER
DALIQLSEIV	LTRDK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у мітохондрії.

Література

Saiki R., Nagata A., Kainou T., Matsuda H., Kawamukai M. (2005). Characterization of solanesyl and decaprenyl diphosphate synthases in mice and humans. FEBS J. 272: 5606—5622. PMID 16262699 DOI:10.1111/j.1742-4658.2005.04956.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504