PDLIM5

PDLIM5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2UZC, 2DAR
Ідентифікатори
Символи	PDLIM5, ENH, ENH1, LIM, L9, PDZ and LIM domain 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605904 MGI: 1927489 HomoloGene: 21289 GeneCards: PDLIM5
Пов'язані генетичні захворювання
	рак простати
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • protein N-terminus binding; • actin binding; • actinin binding; • protein kinase C binding; • cadherin binding involved in cell-cell adhesion; • muscle alpha-actinin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • міжклітинні контакти; • neuron projection; • postsynaptic membrane; • клітинна мембрана; • синапс; • actin cytoskeleton; • мембрана; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • гіалоплазма; • stress fiber; • Z disc; • filamentous actin;
Біологічний процес	• regulation of dendritic spine morphogenesis; • regulation of synapse assembly; • cell-cell adhesion; • cell growth involved in cardiac muscle cell development; • heart development; • actin cytoskeleton organization; • muscle structure development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	10611
	56376
	ENSG00000163110
	ENSMUSG00000028273
	Q96HC4
	Q8CI51
NM_001011513; NM_001011515; NM_001011516; NM_001256425; NM_001256426;
	NM_001256427; NM_001256428; NM_001256429; NM_006457
NM_001190852; NM_001190853; NM_001190854; NM_001190855; NM_001190856;
	NM_001190857; NM_019808; NM_019809; NM_022554
NP_001011513; NP_001011515; NP_001011516; NP_001243354; NP_001243355;
	NP_001243356; NP_001243357; NP_001243358; NP_006448
NP_001177781; NP_001177782; NP_001177783; NP_001177784; NP_001177785;
	NP_001177786; NP_062782; NP_062783; NP_072048
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDLIM5 (англ. PDZ and LIM domain 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 596 амінокислот, а молекулярна маса — 63 945^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSNYSVSLVG	PAPWGFRLQG	GKDFNMPLTI	SSLKDGGKAA	QANVRIGDVV
LSIDGINAQG	MTHLEAQNKI	KGCTGSLNMT	LQRASAAPKP	EPVPVQKGEP
KEVVKPVPIT	SPAVSKVTST	NNMAYNKAPR	PFGSVSSPKV	TSIPSPSSAF
TPAHATTSSH	ASPSPVAAVT	PPLFAASGLH	ANANLSADQS	PSALSAGKTA
VNVPRQPTVT	SVCSETSQEL	AEGQRRGSQG	DSKQQNGPPR	KHIVERYTEF
YHVPTHSDAS	KKRLIEDTED	WRPRTGTTQS	RSFRILAQIT	GTEHLKESEA
DNTKKANNSQ	EPSPQLASSV	ASTRSMPESL	DSPTSGRPGV	TSLTAAAAFK
PVGSTGVIKS	PSWQRPNQGV	PSTGRISNSA	TYSGSVAPAN	SALGQTQPSD
QDTLVQRAEH	IPAGKRTPMC	AHCNQVIRGP	FLVALGKSWH	PEEFNCAHCK
NTMAYIGFVE	EKGALYCELC	YEKFFAPECG	RCQRKILGEV	ISALKQTWHV
SCFVCVACGK	PIRNNVFHLE	DGEPYCETDY	YALFGTICHG	CEFPIEAGDM
FLEALGYTWH	DTCFVCSVCC	ESLEGQTFFS	KKDKPLCKKH	AHSVNF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, синапсах, синаптосомах^[en].

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111