PDLIM2

PDLIM2 (англ. PDZ and LIM domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 37 459.

PDLIM2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PA1, 3PDV
Ідентифікатори
Символи	PDLIM2, MYSTIQUE, SLIM, PDZ and LIM domain 2
Зовнішні ІД	OMIM: 609722 MGI: 2384850 HomoloGene: 11006 GeneCards: PDLIM2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • actin binding • muscle alpha-actinin binding Клітинна компонента • цитоплазма • цитоскелет • клітинне ядро • stress fiber • Z discdkac • filamentous actin Біологічний процес • heart development • actin cytoskeleton organization • muscle structure development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64236	213019
Ensembl	ENSG00000120913	ENSMUSG00000022090
UniProt	Q96JY6	Q8R1G6
RefSeq (мРНК)	NM_198042 NM_021630 NM_176871 NM_001368120	NM_001253736 NM_145978
RefSeq (білок)	NP_067643 NP_789847 NP_932159 NP_001355049	NP_001240665 NP_666090
Локус (UCSC)	Хр. 8: 22.58 – 22.6 Mb	Хр. 14: 70.4 – 70.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALTVDVAGP		APWGFRITGG		RDFHTPIMVT		KVAERGKAKD		ADLRPGDIIV
AINGESAEGM		LHAEAQSKIR		QSPSPLRLQL		DRSQATSPGQ		TNGDSSLEVL
ATRFQGSVRT		YTESQSSLRS		SYSSPTSLSP		RAGSPFSPPP		SSSSLTGEAA
ISRSFQSLAC		SPGLPAADRL		SYSGRPGSRQ		AGLGRAGDSA		VLVLPPSPGP
RSSRPSMDSE		GGSLLLDEDS		EVFKMLQENR		EGRAAPRQSS		SFRLLQEALE
AEERGGTPAF		LPSSLSPQSS		LPASRALATP		PKLHTCEKCS		TSIANQAVRI
QEGRYRHPGC		YTCADCGLNL		KMRGHFWVGD		ELYCEKHARQ		RYSAPATLSS
RA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8