PCM1

PCM1 (англ. Pericentriolar material 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 024 амінокислот, а молекулярна маса — 228 533.

PCM1
Ідентифікатори
Символи	PCM1, PTC4, RET/PCM-1, pericentriolar material 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600299 MGI: 1277958 HomoloGene: 4518 GeneCards: PCM1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • ciliary basal body • cell projection • ядерна мембрана • мембрана • центр організації мікротрубочок • Центріоль • цитоскелет • ciliary transition zone • центросома • centriolar satellite • pericentriolar material • цитоплазма • гіалоплазма • apical part of cell • non-motile cilium • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • positive regulation of intracellular protein transport • neuron migration • neuronal stem cell population maintenance • intraciliary transport involved in cilium assembly • cell projection organization • G2/M transition of mitotic cell cycle • cytoplasmic microtubule organization • negative regulation of neurogenesis • interkinetic nuclear migration • microtubule anchoring at centrosome • protein localization to centrosome • microtubule anchoring • соціальна поведінка • cilium assembly • ciliary basal body-plasma membrane docking • non-motile cilium assembly • centrosome cycle • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein localization to organelle Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5108	18536
Ensembl	ENSG00000078674	ENSMUSG00000031592
UniProt	Q15154	Q9R0L6
RefSeq (мРНК)	NM_006197 NM_001315507 NM_001315508	NM_023662
RefSeq (білок)	NP_001302436 NP_001302437 NP_006188 NP_001339561 NP_001339562 NP_001339563 NP_001339564 NP_001339565 NP_001339566 NP_001339567 NP_001339568 NP_001339569 NP_001339570 NP_001339571 NP_001339572 NP_001339573 NP_001339574 NP_001339575 NP_001339576 NP_001339577 NP_001339578 NP_001339579 NP_001339580 NP_001339581 NP_001339582 NP_001339583 NP_001339584 NP_001339585 NP_001339586 NP_001339587 NP_001339588 NP_001339589 NP_001302436.1	NP_076151 NP_001390746 NP_001390748 NP_001390749 NP_001390752 NP_001390753 NP_001390754
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 8: 41.24 – 41.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATGGGPFED		GMNDQDLPNW		SNENVDDRLN		NMDWGAQQKK		ANRSSEKNKK
KFGVESDKRV		TNDISPESSP		GVGRRRTKTP		HTFPHSRYMS		QMSVPEQAEL
EKLKQRINFS		DLDQRSIGSD		SQGRATAANN		KRQLSENRKP		FNFLPMQINT
NKSKDASTSP		PNRETIGSAQ		CKELFASALS		NDLLQNCQVS		EEDGRGEPAM
ESSQIVSRLV		QIRDYITKAS		SMREDLVEKN		ERSANVERLT		HLIDHLKEQE
KSYMKFLKKI		LARDPQQEPM		EEIENLKKQH		DLLKRMLQQQ		EQLRALQGRQ
AALLALQHKA		EQAIAVMDDS		VVAETAGSLS		GVSITSELNE		ELNDLIQRFH
NQLRDSQPPA		VPDNRRQAES		LSLTREVSQS		RKPSASERLP		DEKVELFSKM
RVLQEKKQKM		DKLLGELHTL		RDQHLNNSSS		SPQRSVDQRS		TSAPSASVGL
APVVNGESNS		LTSSVPYPTA		SLVSQNESEN		EGHLNPSEKL		QKLNEVRKRL
NELRELVHYY		EQTSDMMTDA		VNENRKDEET		EESEYDSEHE		NSEPVTNIRN
PQVASTWNEV		NSHSNAQCVS		NNRDGRTVNS		NCEINNRSAA		NIRALNMPPS
LDCRYNREGE		QEIHVAQGED		DEEEEEEAEE		EGVSGASLSS		HRSSLVDEHP
EDAEFEQKIN		RLMAAKQKLR		QLQDLVAMVQ		DDDAAQGVIS		ASASNLDDFY
PAEEDTKQNS		NNTRGNANKT		QKDTGVNEKA		REKFYEAKLQ		QQQRELKQLQ
EERKKLIDIQ		EKIQALQTAC		PDLQLSAASV		GNCPTKKYMP		AVTSTPTVNQ
HETSTSKSVF		EPEDSSIVDN		ELWSEMRRHE		MLREELRQRR		KQLEALMAEH
QRRQGLAETA		SPVAVSLRSD		GSENLCTPQQ		SRTEKTMATW		GGSTQCALDE
EGDEDGYLSE		GIVRTDEEEE		EEQDASSNDN		FSVCPSNSVN		HNSYNGKETK
NRWKNNCPFS		ADENYRPLAK		TRQQNISMQR		QENLRWVSEL		SYVEEKEQWQ
EQINQLKKQL		DFSVSICQTL		MQDQQTLSCL		LQTLLTGPYS		VMPSNVASPQ
VHFIMHQLNQ		CYTQLTWQQN		NVQRLKQMLN		ELMRQQNQHP		EKPGGKERGS
SASHPPSPSL		FCPFSFPTQP		VNLFNIPGFT		NFSSFAPGMN		FSPLFPSNFG
DFSQNISTPS		EQQQPLAQNS		SGKTEYMAFP		KPFESSSSIG		AEKPRNKKLP
EEEVESSRTP		WLYEQEGEVE		KPFIKTGFSV		SVEKSTSSNR		KNQLDTNGRR
RQFDEESLES		FSSMPDPVDP		TTVTKTFKTR		KASAQASLAS		KDKTPKSKSK
KRNSTQLKSR		VKNIRYESAS		MSSTCEPCKS		RNRHSAQTEE		PVQAKVFSRK
NHEQLEKIIK		CNRSTEISSE		TGSDFSMFEA		LRDTIYSEVA		TLISQNESRP
HFLIELFHEL		QLLNTDYLRQ		RALYALQDIV		SRHISESHEK		GENVKSVNSG
TWIASNSELT		PSESLATTDD		ETFEKNFERE		THKISEQNDA		DNASVLSVSS
NFEPFATDDL		GNTVIHLDQA		LARMREYERM		KTEAESNSNM		RCTCRIIEDG
DGAGAGTTVN		NLEETPVIEN		RSSQQPVSEV		STIPCPRIDT		QQLDRQIKAI
MKEVIPFLKE		HMDEVCSSQL		LTSVRRMVLT		LTQQNDESKE		FVKFFHKQLG
SILQDSLAKF		AGRKLKDCGE		DLLVEISEVL		FNELAFFKLM		QDLDNNSITV
KQRCKRKIEA		TGVIQSCAKE		AKRILEDHGS		PAGEIDDEDK		DKDETETVKQ
TQTSEVYDGP		KNVRSDISDQ		EEDEESEGCP		VSINLSKAET		QALTNYGSGE
DENEDEEMEE		FEEGPVDVQT		SLQANTEATE		ENEHDEQVLQ		RDFKKTAESK
NVPLEREATS		KNDQNNCPVK		PCYLNILEDE		QPLNSAAHKE		SPPTVDSTQQ
PNPLPLRLPE		MEPLVPRVKE		VKSAQETPES		SLAGSPDTES		PVLVNDYEAE
SGNISQKSDE		EDFVKVEDLP		LKLTIYSEAD		LRKKMVEEEQ		KNHLSGEICE
MQTEELAGNS		ETLKEPETVG		AQSI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках.

Література

• Balczon R., Bao L., Zimmer W.E. (1994). PCM-1, A 228-kD centrosome autoantigen with a distinct cell cycle distribution. J. Cell Biol. 124: 783—793. PMID 8120099 DOI:10.1083/jcb.124.5.783
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Corvi R., Berger N., Balczon R., Romeo G. (2000). RET/PCM-1: a novel fusion gene in papillary thyroid carcinoma. Oncogene. 19: 4236—4242. PMID 10980597 DOI:10.1038/sj.onc.1203772
• Dammermann A., Merdes A. (2002). Assembly of centrosomal proteins and microtubule organization depends on PCM-1. J. Cell Biol. 159: 255—266. PMID 12403812 DOI:10.1083/jcb.200204023
• Srsen V., Gnadt N., Dammermann A., Merdes A. (2006). Inhibition of centrosome protein assembly leads to p53-dependent exit from the cell cycle. J. Cell Biol. 174: 625—630. PMID 16943179 DOI:10.1083/jcb.200606051
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 8