PCDHGC3

PCDHGC3 (англ. Protocadherin gamma subfamily C, 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 934 амінокислот, а молекулярна маса — 101 077.

PCDHGC3
Ідентифікатори
Символи	PCDHGC3, PC43, PCDH-GAMMA-C3, PCDH2, protocadherin gamma subfamily C, 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603627 MGI: 1935201 HomoloGene: 31099 GeneCards: PCDHGC3
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку • synapse organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5098	93706
Ensembl	ENSG00000240184	ENSMUSG00000102918
UniProt	Q9UN70	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_032403 NM_002588 NM_032402	NM_033581
RefSeq (білок)	NP_002579 NP_115778 NP_115779	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.48 – 141.51 Mb	Хр. 18: 37.94 – 37.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVPEAWRSGL		VSTGRVVGVL		LLLGALNKAS		TVIHYEIPEE		REKGFAVGNV
VANLGLDLGS		LSARRFRVVS		GASRRFFEVN		RETGEMFVND		RLDREELCGT
LPSCTVTLEL		VVENPLELFS		VEVVIQDIND		NNPAFPTQEM		KLEISEAVAP
GTRFPLESAH		DPDVGSNSLQ		TYELSRNEYF		ALRVQTREDS		TKYAELVLER
ALDREREPSL		QLVLTALDGG		TPALSASLPI		HIKVLDANDN		APVFNQSLYR
ARVLEDAPSG		TRVVQVLATD		LDEGPNGEII		YSFGSHNRAG		VRQLFALDLV
TGMLTIKGRL		DFEDTKLHEI		YIQAKDKGAN		PEGAHCKVLV		EVVDVNDNAP
EITVTSVYSP		VPEDAPLGTV		IALLSVTDLD		AGENGLVTCE		VPPGLPFSLT
SSLKNYFTLK		TSADLDRETV		PEYNLSITAR		DAGTPSLSAL		TIVRVQVSDI
NDNPPQSSQS		SYDVYIEENN		LPGAPILNLS		VWDPDAPQNA		RLSFFLLEQG
AETGLVGRYF		TINRDNGIVS		SLVPLDYEDR		REFELTAHIS		DGGTPVLATN
ISVNIFVTDR		NDNAPQVLYP		RPGGSSVEML		PRGTSAGHLV		SRVVGWDADA
GHNAWLSYSL		LGSPNQSLFA		IGLHTGQIST		ARPVQDTDSP		RQTLTVLIKD
NGEPSLSTTA		TLTVSVTEDS		PEARAEFPSG		SAPREQKKNL		TFYLLLSLIL
VSVGFVVTVF		GVIIFKVYKW		KQSRDLYRAP		VSSLYRTPGP		SLHADAVRGG
LMSPHLYHQV		YLTTDSRRSD		PLLKKPGAAS		PLASRQNTLR		SCDPVFYRQV
LGAESAPPGQ		QAPPNTDWRF		SQAQRPGTSG		SQNGDDTGTW		PNNQFDTEML
QAMILASASE		AADGSSTLGG		GAGTMGLSAR		YGPQFTLQHV		PDYRQNVYIP
GSNATLTNAA		GKRDGKAPAG		GNGNKKKSGK		KEKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5