PCDHGB4

PCDHGB4 (англ. Protocadherin gamma subfamily B, 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 923 амінокислот, а молекулярна маса — 99 927.

PCDHGB4
Ідентифікатори
Символи	PCDHGB4, CDH20, FIB2, PCDH-GAMMA-B4, protocadherin gamma subfamily B, 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603058 MGI: 1935173 HomoloGene: 74507 GeneCards: PCDHGB4
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8641	93701
Ensembl	ENSG00000253953	ENSMUSG00000103585
UniProt	Q9UN71	Q91XX6
RefSeq (мРНК)	NM_032098 NM_003736	NM_033576
RefSeq (білок)	NP_003727 NP_115269	NP_291054
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.39 – 141.51 Mb	Хр. 18: 37.85 – 37.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSGAGELGR		AERLPVLFLF		LLSLFCPALC		EQIRYRIPEE		MPKGSVVGNL
ATDLGFSVQE		LPTRKLRVSS		EKPYFTVSAE		SGELLVSSRL		DREEICGKKP
ACALEFEAVA		ENPLNFYHVN		VEIEDINDHT		PKFTQNSFEL		QISESAQPGT
RFILGSAHDA		DIGSNTLQNY		QLSPSDHFSL		INKEKSDGSK		YPEMVLKTPL
DREKQKSYHL		TLTALDFGAP		PLSSTAQIHV		LVTDANDNAP		VFSQDVYRVS
LSENVYPGTT		VLQVTATDQD		EGVNAEITFS		FSEASQITQF		DLNSNTGEIT
VLNTLDFEEV		KEYSIVLEAR		DGGGMIAQCT		VEVEVIDEND		NAPEVIFQSL
PNLIMEDAEL		GTHIALLKVR		DKDSRHNGEV		TCKLEGDVPF		KILTSSRNTY
KLVTDAVLDR		EQNPEYNITV		TATDRGKPPL		SSSSSITLHI		GDVNDNAPVF
SQSSYIVHVA		ENNPPGASIS		QVRASDPDLG		PNGQVSYCIM		ASDLEQRELS
SYVSISAESG		VVFAQRAFDH		EQLRAFELTL		QARDQGSPAL		SANVSLRVLV
DDRNDNAPRV		LYPALGPDGS		ALFDMVPHAA		EPGYLVTKVV		AVDADSGHNA
WLSYHVLQAS		EPGLFSLGLR		TGEVRTARAL		GDRDAVRQRL		LVAVRDGGQP
PLSATATLHL		VFADSLQEVL		PDITDRPDPS		DLQAELQFYL		VVALALISVL
FLVAMILAIA		LRLRRSSSPA		SWSCFQPGLC		VKSESVVPPN		YSEGTLPYSY
NLCVAHTGKT		EFNFLKCSEQ		LSSGQDILCG		DSSGALFPLC		NSSELTSHQQ
APPNTDWRFS		QAQRPGTSGS		QNGDDTGTWP		NNQFDTEMLQ		AMILASASEA
ADGSSTLGGG		AGTMGLSARY		GPQFTLQHVP		DYRQNVYIPG		SNATLTNAAG
KRDGKAPAGG		NGNKKKSGKK		EKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Matsuyoshi N., Imamura S. (1997). Multiple cadherins are expressed in human fibroblasts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 235: 355—358. PMID 9199196 DOI:10.1006/bbrc.1997.6707

Див. також

• Хромосома 5